More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3365 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  100 
 
 		 297 aa  593  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  66.79 
 
 		 298 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  72.52 
 
 		 307 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  72.08 
 
 		 286 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  72.14 
 
 		 307 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  64.98 
 
 		 298 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  74.52 
 
 		 295 aa  398  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  72.8 
 
 		 304 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  65.62 
 
 		 301 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  70.61 
 
 		 307 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  65.93 
 
 		 301 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  43.73 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  41.84 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  40.28 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  29.51 
 
 		 284 aa  136  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  29.17 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  30.68 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  30.68 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  30.68 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  30.68 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  30.68 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  30.3 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  30.85 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  28.82 
 
 		 284 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  32.22 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  32.22 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  32.22 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  31.78 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  34.67 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  32.57 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  36.9 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  30.71 
 
 		 282 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  29.86 
 
 		 306 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  32 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  28.69 
 
 		 271 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  33.86 
 
 		 282 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  30.61 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2922  hypothetical protein  28.14 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  30.61 
 
 		 307 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  29.29 
 
 		 290 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  28.92 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  34.71 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252623 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  27.66 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  31.84 
 
 		 266 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  38.32 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  31.91 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  34.85 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  29.72 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  27.08 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  32.06 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  30 
 
 		 285 aa  89  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  28.62 
 
 		 314 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  33.8 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.2 
 
 		 294 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  26.67 
 
 		 265 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  28.45 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  27.35 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  32.39 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  31.51 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  26.47 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  28.44 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3467  hypothetical protein  27.49 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  30.7 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  31.3 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  30.05 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1129  bem46 protein  30.4 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.578173  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.29 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  27.86 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  27.09 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  31.07 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  30.8 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  31.53 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.51 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  33.18 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  34.45 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  34.45 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.92 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  34.45 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2823  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  30.6 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  hitchhiker  0.0000422692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  26.69 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.7 
 
 		 364 aa  72.4  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  29.96 
 
 		 274 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  27.88 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  26.2 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119577  Protein bem46-like protein  28.03 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15434  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  24.12 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02210  conserved hypothetical protein  27.07 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  32.74 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.39 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  28.69 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1061  temperature sensitive supressor-like protein  30 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.133168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0187  hypothetical protein  27.91 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  29.56 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  29.11 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0358  hypothetical protein  32.58 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233875  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.23 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47043  predicted protein  27.71 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.33463  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3153  hypothetical protein  29.55 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.913787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>