30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3257 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3257  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  280  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  50.36 
 
 		 140 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  49.64 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1246  putative lipoprotein  30.15 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3706  hypothetical protein  35.11 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  56.82 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  29.53 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0845  hypothetical protein  29.37 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287816 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  43.9 
 
 		 186 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  43.9 
 
 		 186 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  38.75 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0980  hypothetical protein  28.23 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  30.41 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  24 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  32.43 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  45.65 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  43.48 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  43.48 
 
 		 168 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  43.48 
 
 		 168 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  24.31 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  26.35 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  34.78 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  51.72 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0526  hypothetical protein  26.53 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.182831 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0399  hypothetical protein  39.39 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0521  hypothetical protein  26.03 
 
 		 162 aa  41.2  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759157 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  34.02 
 
 		 157 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0696  hypothetical protein  44.12 
 
 		 203 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3301  hypothetical protein  45.83 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  36.96 
 
 		 178 aa  40.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.31492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>