38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3250 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3250  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2516  hypothetical protein  55.35 
 
 		 223 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2710  hypothetical protein  59.9 
 
 		 225 aa  254  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2569  hypothetical protein  59.39 
 
 		 225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  53.42 
 
 		 225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3145  hypothetical protein  58.38 
 
 		 273 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20600  hypothetical protein  53.36 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000461916  normal  0.707445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1768  putative lipoprotein  53.36 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3047  putative lipoprotein  50.92 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2705  hypothetical protein  51.69 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1978  putative outer membrane lipoprotein  36.06 
 
 		 223 aa  164  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.931993 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2216  conserved hypothetical protein  38.12 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.90262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2229  hypothetical protein  38.12 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1513  putative lipoprotein  38.12 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1744  putative lipoprotein  38.12 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000116724  unclonable  1.13256e-21 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2036  putative lipoprotein  38.12 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000423707  unclonable  9.72589e-25 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01399  hypothetical protein  38.12 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01388  predicted lipoprotein  38.12 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1609  putative lipoprotein  37.62 
 
 		 222 aa  161  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1724  putative lipoprotein  36.54 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0895113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1735  putative lipoprotein  36.54 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1554  putative lipoprotein  36.54 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1785  hypothetical protein  36.54 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1721  putative lipoprotein  36.54 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0167  hypothetical protein  44.61 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3695  hypothetical protein  37.38 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.54497 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3873  hypothetical protein  35.68 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4813  hypothetical protein  38.27 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.910755  hitchhiker  0.000170141 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  32.85 
 
 		 230 aa  128  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.483058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33730  hypothetical protein  31.16 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  34.16 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  26.61 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  24.43 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2561  putative lipoprotein  21.43 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.45576  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1467  hypothetical protein  26.45 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0985  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0501  hypothetical protein  21.76 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2893  lipoprotein  29.01 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000297735  normal  0.82105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>