More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3210 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  100 
 
 		 540 aa  1040    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  58.66 
 
 		 509 aa  552  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  59.11 
 
 		 508 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  60 
 
 		 516 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  54.03 
 
 		 526 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  52.58 
 
 		 528 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  52.12 
 
 		 524 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  54.44 
 
 		 536 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  57.2 
 
 		 481 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  47.38 
 
 		 518 aa  425  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  50.68 
 
 		 558 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 529 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  51.71 
 
 		 521 aa  415  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  49.89 
 
 		 562 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  51.92 
 
 		 517 aa  415  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  49.6 
 
 		 501 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  49.51 
 
 		 513 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  48.4 
 
 		 553 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  53.04 
 
 		 496 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  51.92 
 
 		 509 aa  405  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  51.82 
 
 		 539 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  45.63 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  50.1 
 
 		 575 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 		 528 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  49.41 
 
 		 588 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 509 aa  365  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  43.9 
 
 		 509 aa  365  1e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  53.66 
 
 		 502 aa  363  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 528 aa  362  1e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  44.22 
 
 		 584 aa  355  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  44.98 
 
 		 541 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  48.63 
 
 		 506 aa  353  2.9999999999999997e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 497 aa  352  8e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  43 
 
 		 516 aa  352  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  43.37 
 
 		 532 aa  351  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  42.37 
 
 		 519 aa  350  3e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  52.09 
 
 		 477 aa  350  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  46.86 
 
 		 554 aa  344  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  46.27 
 
 		 521 aa  344  2.9999999999999997e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  44.79 
 
 		 535 aa  339  9e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  45.66 
 
 		 514 aa  332  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  45.42 
 
 		 601 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  47.33 
 
 		 513 aa  330  6e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  44.54 
 
 		 513 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  47.67 
 
 		 563 aa  326  6e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  41.97 
 
 		 555 aa  325  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  42.06 
 
 		 525 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  42.06 
 
 		 525 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  42.06 
 
 		 525 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.71 
 
 		 537 aa  318  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  42.65 
 
 		 503 aa  317  5e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  43.76 
 
 		 524 aa  316  8e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 533 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  44.61 
 
 		 535 aa  301  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 		 508 aa  298  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  41.78 
 
 		 505 aa  297  3e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  38.43 
 
 		 490 aa  296  6e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  39.63 
 
 		 511 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 		 536 aa  283  7.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 		 517 aa  276  7e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  40.29 
 
 		 516 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 516 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 		 510 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  43.1 
 
 		 528 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  38.53 
 
 		 492 aa  263  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 		 500 aa  262  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  39.2 
 
 		 517 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 		 500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  35.76 
 
 		 500 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.02 
 
 		 534 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.04 
 
 		 538 aa  247  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 520 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.43 
 
 		 525 aa  243  9e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.45 
 
 		 503 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  38.87 
 
 		 514 aa  240  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  36.35 
 
 		 516 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 494 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 503 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 504 aa  236  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  33.47 
 
 		 495 aa  232  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.06 
 
 		 522 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  39.83 
 
 		 511 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 519 aa  225  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.55 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  37.98 
 
 		 501 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 		 607 aa  217  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  33.61 
 
 		 513 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 		 501 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 		 506 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 		 507 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.27 
 
 		 520 aa  211  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  37.66 
 
 		 501 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 509 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.85 
 
 		 626 aa  207  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.48 
 
 		 519 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  34.38 
 
 		 495 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  34.38 
 
 		 495 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  34.38 
 
 		 495 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3332  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 515 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  35.91 
 
 		 501 aa  206  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>