More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3182 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3182  protein kinase  100 
 
 		 494 aa  991    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0356849  normal  0.234738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  47.1 
 
 		 1018 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  46.89 
 
 		 1032 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  46.89 
 
 		 1032 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  38.71 
 
 		 604 aa  203  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2434  Serine/threonine protein kinase-like  42.8 
 
 		 896 aa  200  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0164734  normal  0.121518 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2753  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.63 
 
 		 517 aa  195  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  41.37 
 
 		 646 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  38.21 
 
 		 776 aa  190  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  40.75 
 
 		 666 aa  187  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  39.7 
 
 		 673 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  37.69 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.83 
 
 		 511 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.98 
 
 		 520 aa  183  6e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.15 
 
 		 598 aa  182  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  40.82 
 
 		 468 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  38 
 
 		 612 aa  181  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.87 
 
 		 658 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.41 
 
 		 591 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.5 
 
 		 668 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.45 
 
 		 551 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.4 
 
 		 645 aa  177  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  41.11 
 
 		 585 aa  177  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.46 
 
 		 584 aa  177  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  36.93 
 
 		 593 aa  177  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.74 
 
 		 528 aa  176  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  38.01 
 
 		 613 aa  176  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  40.08 
 
 		 642 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  41.95 
 
 		 599 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.23 
 
 		 715 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.08 
 
 		 667 aa  172  9e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  38.96 
 
 		 641 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.21 
 
 		 1044 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  39.52 
 
 		 1104 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  37.22 
 
 		 569 aa  171  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  40.6 
 
 		 618 aa  170  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  38.93 
 
 		 651 aa  170  6e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.7 
 
 		 662 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 		 571 aa  170  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  36.4 
 
 		 825 aa  170  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  39.39 
 
 		 662 aa  169  8e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37 
 
 		 627 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5526  serine/threonine protein kinase  40.62 
 
 		 576 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.539423 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5928  protein kinase  40.62 
 
 		 576 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.41 
 
 		 602 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  40.94 
 
 		 530 aa  169  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  38.41 
 
 		 638 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  34.56 
 
 		 625 aa  168  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.19 
 
 		 880 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  37.5 
 
 		 790 aa  167  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0031  kinase domain protein  38.75 
 
 		 320 aa  167  4e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1209  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.03 
 
 		 557 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  37.67 
 
 		 502 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.05 
 
 		 822 aa  167  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  36 
 
 		 634 aa  167  5e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.49 
 
 		 607 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  37.02 
 
 		 554 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  43.9 
 
 		 646 aa  166  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  38.13 
 
 		 651 aa  166  9e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 		 985 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  36.62 
 
 		 763 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  36.01 
 
 		 625 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.55 
 
 		 653 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  38.31 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  38.26 
 
 		 692 aa  166  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  38.8 
 
 		 557 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  38.81 
 
 		 497 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  37.63 
 
 		 672 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  35.64 
 
 		 891 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  38.34 
 
 		 623 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  36.73 
 
 		 565 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3624  serine/threonine protein kinase  39.11 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401978  decreased coverage  0.000211559 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.29 
 
 		 641 aa  164  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  36.5 
 
 		 666 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0052  serine/threonine protein kinase  38.08 
 
 		 475 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  37.15 
 
 		 573 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  40.35 
 
 		 647 aa  164  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  37.25 
 
 		 656 aa  163  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  37.08 
 
 		 620 aa  163  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.5 
 
 		 650 aa  162  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  36.71 
 
 		 703 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  38.91 
 
 		 617 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  40.94 
 
 		 1034 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.84 
 
 		 603 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.97 
 
 		 798 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  37.37 
 
 		 618 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  36.88 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  36.88 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  36.88 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3485  serine/threonine protein kinase  38.15 
 
 		 754 aa  161  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000103616  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  38.4 
 
 		 316 aa  161  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0362  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 632 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.79 
 
 		 647 aa  161  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6755  serine/threonine protein kinase  36.9 
 
 		 597 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0201  serine/threonine protein kinase  36.88 
 
 		 729 aa  160  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5349  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.72 
 
 		 1016 aa  160  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  38.31 
 
 		 863 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  38.69 
 
 		 710 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  39.85 
 
 		 561 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  37.41 
 
 		 1053 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>