85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3174 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  472  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  71.49 
 
 		 246 aa  292  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  43.53 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  43.39 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  43.39 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  42.98 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  42.92 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  43.28 
 
 		 245 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  44.73 
 
 		 252 aa  181  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  42.98 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  42.98 
 
 		 245 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  42.56 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  41.84 
 
 		 257 aa  171  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  41.67 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  39.92 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  39.17 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  40.08 
 
 		 260 aa  161  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  43.1 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  41.3 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  39.67 
 
 		 252 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  37.24 
 
 		 244 aa  151  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  40.16 
 
 		 256 aa  151  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  40.33 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  39.39 
 
 		 254 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  39.83 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  40.41 
 
 		 259 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  38.68 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  38.93 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  38.49 
 
 		 255 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  40.59 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  39.33 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  40.76 
 
 		 245 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  36.82 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  46.99 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  39.23 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  39.23 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  35.86 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  34.85 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  32.37 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  32.37 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  32.37 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  38.07 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  33.47 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  31.84 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  32.58 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  30.3 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  28.92 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  29.63 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  31.98 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  30.49 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  27.3 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  29.44 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  27.39 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  28.99 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  28.48 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  28.48 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  31.84 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  29.57 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  30.04 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14860  protein of unknown function DUF81  45.45 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0324626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  24.32 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  32.34 
 
 		 235 aa  52.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  29.87 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  30.13 
 
 		 261 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  25.71 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  29.69 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  25.56 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  31.14 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  27.98 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  27.44 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1229  protein of unknown function DUF81  27.19 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  27.43 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  27.12 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5609  protein of unknown function DUF81  29.03 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  24.34 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  26.35 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  25.42 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  25.21 
 
 		 242 aa  42.7  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  28.68 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  26.2 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1760  permease  28.8 
 
 		 251 aa  42  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0188  permease  27.52 
 
 		 197 aa  42  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  25.94 
 
 		 240 aa  42  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  26.09 
 
 		 252 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>