More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3127 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  100 
 
 
371 aa  758    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  59.35 
 
 
369 aa  464  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  60.93 
 
 
369 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  60.93 
 
 
369 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  60.93 
 
 
369 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4624  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  60.43 
 
 
369 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102994 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4422  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  60.43 
 
 
369 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031053 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4572  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  60.43 
 
 
369 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4573  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  60.43 
 
 
369 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.01143 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4487  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  60.43 
 
 
369 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0240  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  60.43 
 
 
369 aa  463  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  58.54 
 
 
372 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03907  fused maltose transport subunit, ATP-binding component of ABC superfamily/regulatory protein  59.3 
 
 
371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3960  ABC transporter related protein  59.3 
 
 
371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03867  hypothetical protein  59.3 
 
 
371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4275  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  59.3 
 
 
371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4587  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  59.3 
 
 
371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5516  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  59.3 
 
 
371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4497  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  59.3 
 
 
371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3994  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  59.3 
 
 
371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.153747  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  57.72 
 
 
373 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05213  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  58.27 
 
 
372 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  57.49 
 
 
375 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  55.71 
 
 
379 aa  426  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  57.82 
 
 
395 aa  421  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  58.86 
 
 
376 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  58.31 
 
 
380 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  57.92 
 
 
369 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.04 
 
 
370 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  58.04 
 
 
370 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  57.73 
 
 
369 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.04 
 
 
370 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.04 
 
 
370 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.04 
 
 
370 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.04 
 
 
388 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.04 
 
 
370 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  57.46 
 
 
369 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  55.49 
 
 
369 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  57.18 
 
 
369 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  57.46 
 
 
369 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.28 
 
 
370 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  53.53 
 
 
367 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  56.28 
 
 
369 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  56.91 
 
 
368 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  57.58 
 
 
369 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  56.91 
 
 
368 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  56.28 
 
 
369 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  57.02 
 
 
369 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  54.9 
 
 
368 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  53.26 
 
 
372 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.28 
 
 
365 aa  398  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  54.62 
 
 
361 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  54.72 
 
 
367 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  54.06 
 
 
368 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  54.06 
 
 
368 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  53.91 
 
 
369 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  55.22 
 
 
377 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  56.91 
 
 
368 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5485  ABC transporter related  54.96 
 
 
382 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011502 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  54.06 
 
 
366 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  56.75 
 
 
381 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3198  ABC transporter related  55.11 
 
 
382 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  53.76 
 
 
370 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4930  ABC transporter related  54.03 
 
 
382 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  53.76 
 
 
370 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  52.83 
 
 
370 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  54.97 
 
 
377 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.12 
 
 
359 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  55.56 
 
 
360 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4579  ABC transporter related  54.4 
 
 
385 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000381614 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  55.43 
 
 
358 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4584  ABC transporter related  54.4 
 
 
384 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493214  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2353  ABC transporter related  54.79 
 
 
383 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5203  ABC transporter related  54.4 
 
 
385 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300266  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  55.99 
 
 
360 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5656  ABC transporter related  54.4 
 
 
385 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115239  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  51.66 
 
 
371 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5686  ABC transporter related  54.14 
 
 
377 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.661701  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  56.11 
 
 
380 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  54.47 
 
 
359 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  53.17 
 
 
391 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  54.32 
 
 
358 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  53.09 
 
 
363 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  53.48 
 
 
361 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6630  ABC transporter related  53.59 
 
 
377 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  53.3 
 
 
363 aa  378  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0063  ABC transporter related  51.65 
 
 
364 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  52.38 
 
 
360 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  53.31 
 
 
365 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  53.2 
 
 
363 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  54.6 
 
 
368 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  52.1 
 
 
360 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  52.39 
 
 
360 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  52.73 
 
 
359 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  56.72 
 
 
366 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  56.12 
 
 
366 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  51.69 
 
 
353 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  52.65 
 
 
361 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  52.09 
 
 
378 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  51.79 
 
 
366 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>