228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3119 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  100 
 
 		 420 aa  811    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  73.33 
 
 		 429 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  48.98 
 
 		 412 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  44.31 
 
 		 447 aa  289  7e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  41.78 
 
 		 436 aa  280  4e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  43.37 
 
 		 415 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 427 aa  266  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 428 aa  255  8e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  39.22 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  37.35 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 412 aa  232  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 429 aa  229  8e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 443 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  35.11 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  37.31 
 
 		 412 aa  220  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  35.05 
 
 		 397 aa  219  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  36.82 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  33.58 
 
 		 418 aa  216  7e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 416 aa  216  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  33.58 
 
 		 418 aa  216  9e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 412 aa  213  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 424 aa  212  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 408 aa  212  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  40.69 
 
 		 471 aa  212  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  33.24 
 
 		 429 aa  210  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 471 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 425 aa  207  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  35.41 
 
 		 430 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 432 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  33.61 
 
 		 726 aa  206  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  36.59 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 713 aa  202  6e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 421 aa  202  9e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  36.31 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 431 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 481 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  37.5 
 
 		 438 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  37 
 
 		 480 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 474 aa  195  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  35.43 
 
 		 520 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  37.05 
 
 		 438 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 409 aa  193  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 476 aa  193  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 476 aa  192  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  39.75 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  33.25 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  33.03 
 
 		 474 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 452 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  37.63 
 
 		 434 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 		 454 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 432 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  34.81 
 
 		 426 aa  189  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  35.45 
 
 		 474 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  37.37 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 446 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  36.19 
 
 		 444 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  36.71 
 
 		 465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 473 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 447 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 436 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  33.08 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 436 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0101  major facilitator transporter  38.2 
 
 		 426 aa  172  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  34.45 
 
 		 414 aa  170  6e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  29.02 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  29.29 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  28.99 
 
 		 407 aa  159  9e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  30.85 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  28.5 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0467  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 439 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.677382 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  29.16 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  32.14 
 
 		 385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2680  putative MFS family transporter protein  30.82 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2592  putative MFS family transporter protein  30.82 
 
 		 382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  31.38 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  29.85 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  29.22 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>