More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3054 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  100 
 
 		 260 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  88.08 
 
 		 261 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  87.69 
 
 		 261 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  85.77 
 
 		 260 aa  480  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  85.77 
 
 		 260 aa  480  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  85.38 
 
 		 260 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  86.1 
 
 		 260 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  85 
 
 		 260 aa  477  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  83.46 
 
 		 260 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  81.85 
 
 		 260 aa  461  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  81.85 
 
 		 260 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  78.91 
 
 		 256 aa  430  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  75.78 
 
 		 258 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  71.48 
 
 		 258 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  71.48 
 
 		 270 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  72.37 
 
 		 262 aa  393  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  70.77 
 
 		 261 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  72.73 
 
 		 254 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  72.73 
 
 		 254 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  70.75 
 
 		 258 aa  384  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  70.38 
 
 		 264 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  69.5 
 
 		 263 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  67.05 
 
 		 266 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  67.07 
 
 		 255 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  67.06 
 
 		 255 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  65.5 
 
 		 261 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  68.48 
 
 		 264 aa  362  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  68.48 
 
 		 264 aa  362  3e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  68.48 
 
 		 264 aa  362  3e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  68.48 
 
 		 264 aa  362  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  68.48 
 
 		 264 aa  362  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  68.48 
 
 		 264 aa  362  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  68.48 
 
 		 264 aa  362  3e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  68.48 
 
 		 264 aa  362  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  68.48 
 
 		 264 aa  362  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0706  methionine aminopeptidase  68.09 
 
 		 264 aa  360  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.426508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  65.52 
 
 		 267 aa  357  8e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  68.48 
 
 		 264 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  68.48 
 
 		 264 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  68.48 
 
 		 264 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  68.48 
 
 		 264 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  68.48 
 
 		 264 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  65.62 
 
 		 266 aa  355  3.9999999999999996e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3791  methionine aminopeptidase  66.15 
 
 		 264 aa  355  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168948 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0396  methionine aminopeptidase, type I  65.48 
 
 		 264 aa  354  6.999999999999999e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497422 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  64.57 
 
 		 270 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0442  methionine aminopeptidase, type I  65.08 
 
 		 264 aa  354  7.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1065  methionine aminopeptidase  66.15 
 
 		 263 aa  353  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  66.15 
 
 		 263 aa  353  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000377508  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0940  methionine aminopeptidase  66.15 
 
 		 264 aa  353  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0128309  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  65.23 
 
 		 269 aa  352  4e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  64.45 
 
 		 267 aa  351  8e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  66.27 
 
 		 284 aa  350  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3361  methionine aminopeptidase  65.37 
 
 		 264 aa  349  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  63.53 
 
 		 258 aa  350  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0221  hypothetical protein  63.75 
 
 		 253 aa  348  5e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  63.75 
 
 		 253 aa  347  1e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  63.67 
 
 		 267 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  63.81 
 
 		 258 aa  346  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  63.39 
 
 		 259 aa  345  4e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  63.39 
 
 		 259 aa  344  7e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1434  methionine aminopeptidase  62.21 
 
 		 272 aa  344  8e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2179  methionine aminopeptidase  66.67 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0164635  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0557  methionine aminopeptidase, type I  63.71 
 
 		 266 aa  343  2e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.484124  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1271  methionine aminopeptidase, type I  65.85 
 
 		 285 aa  342  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0521675  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  61.72 
 
 		 271 aa  340  9e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1852  methionine aminopeptidase  62.32 
 
 		 280 aa  340  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000190489  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  62.35 
 
 		 261 aa  340  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3166  methionine aminopeptidase, type I  62.65 
 
 		 264 aa  340  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  61.96 
 
 		 261 aa  339  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2982  methionine aminopeptidase, type I  62.65 
 
 		 264 aa  338  5e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  61.18 
 
 		 261 aa  337  9e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1452  methionine aminopeptidase, type I  62.98 
 
 		 278 aa  337  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.814103  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  60.84 
 
 		 275 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  62.02 
 
 		 269 aa  335  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  62.02 
 
 		 269 aa  335  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0506  methionine aminopeptidase, type I  62.21 
 
 		 278 aa  335  5.999999999999999e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.224089  normal  0.874449 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  60.55 
 
 		 271 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  60.55 
 
 		 271 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  59.3 
 
 		 268 aa  333  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  60.55 
 
 		 271 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  60.55 
 
 		 271 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  60.55 
 
 		 271 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  60.55 
 
 		 271 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  60.55 
 
 		 271 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1341  methionine aminopeptidase  61.48 
 
 		 274 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1882  methionine aminopeptidase  59.92 
 
 		 272 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  62.5 
 
 		 275 aa  332  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  61.69 
 
 		 274 aa  332  5e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  59.22 
 
 		 268 aa  331  8e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1256  methionine aminopeptidase  61.72 
 
 		 271 aa  330  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1277  methionine aminopeptidase  60.7 
 
 		 274 aa  329  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0562  methionine aminopeptidase, type I  59.47 
 
 		 263 aa  328  4e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1922  methionine aminopeptidase  61.72 
 
 		 271 aa  328  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  60.62 
 
 		 284 aa  328  8e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2020  methionine aminopeptidase  60.94 
 
 		 271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  58.14 
 
 		 268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  58.14 
 
 		 268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6057  methionine aminopeptidase  60.94 
 
 		 271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  58.1 
 
 		 261 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>