66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2966 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2966  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  337  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0041354  normal  0.102756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1639  hypothetical protein  76.22 
 
 		 164 aa  263  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4078  hypothetical protein  76.22 
 
 		 164 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1241  hypothetical protein  74.39 
 
 		 164 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000128773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1201  hypothetical protein  75.61 
 
 		 164 aa  256  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3706  hypothetical protein  72.56 
 
 		 164 aa  254  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4234  hypothetical protein  72.56 
 
 		 164 aa  253  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4190  hypothetical protein  73.29 
 
 		 165 aa  249  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49060  hypothetical protein  73.91 
 
 		 165 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203632  hitchhiker  0.000000135384 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1683  peptidase, SprT family  71.95 
 
 		 164 aa  248  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.781786  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33250  hypothetical protein  67.07 
 
 		 164 aa  233  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.115665  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3330  hypothetical protein  48.41 
 
 		 201 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0277435  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0692  hypothetical protein  48.41 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000345273  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3442  hypothetical protein  47.47 
 
 		 201 aa  154  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000887757  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4132  protein of unknown function DUF335 SprT  47.68 
 
 		 212 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0834  hypothetical protein  46.15 
 
 		 206 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3222  protein of unknown function DUF335, SprT  50 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00097264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3159  protein of unknown function DUF335, SprT  46.41 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000619203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3970  protein of unknown function DUF335, SprT  46.1 
 
 		 191 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0836  protein of unknown function DUF335 SprT  47.06 
 
 		 219 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00977603  hitchhiker  0.0000107184 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3524  hypothetical protein  46.41 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204925  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0811  protein of unknown function DUF335 SprT  46.41 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000376161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0843  protein of unknown function DUF335 SprT  45.1 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0209179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0545  protein of unknown function DUF335, SprT  43.79 
 
 		 203 aa  137  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.510358  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2229  protein of unknown function DUF335 SprT  40.65 
 
 		 174 aa  137  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.354031  normal  0.796923 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01642  hypothetical protein  43.84 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0602  protein of unknown function DUF335 SprT  43.23 
 
 		 188 aa  134  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2972  hypothetical protein  46.41 
 
 		 219 aa  133  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.609934  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03570  hypothetical protein  40.4 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002465  protein SprT  42.38 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1624  hypothetical protein  39.22 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0864  hypothetical protein  43.4 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0577  sprT protein, putative  41.29 
 
 		 184 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00218492  normal  0.10682 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3228  protein of unknown function DUF335, SprT  37.42 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0023  hypothetical protein  36.77 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2368  protein of unknown function DUF335, SprT  39.74 
 
 		 176 aa  118  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0781299  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0551  hypothetical protein  37.75 
 
 		 161 aa  113  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0840  hypothetical protein  35.86 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3346  hypothetical protein  34.97 
 
 		 187 aa  100  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3708  hypothetical protein  35.62 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000576402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3906  hypothetical protein  34.38 
 
 		 170 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000939538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4023  hypothetical protein  35.17 
 
 		 170 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000235855  decreased coverage  0.000372984 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0842  hypothetical protein  34.36 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000365146  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3376  hypothetical protein  37.59 
 
 		 165 aa  99  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0751  protein of unknown function DUF335 SprT  36.88 
 
 		 165 aa  97.1  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.067857  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02737  hypothetical protein  36.88 
 
 		 165 aa  97.1  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3102  hypothetical protein  36.88 
 
 		 165 aa  97.1  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3086  hypothetical protein  36.88 
 
 		 165 aa  97.1  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0374593  hitchhiker  0.00021739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02774  hypothetical protein  36.88 
 
 		 165 aa  97.1  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.110605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0770  hypothetical protein  36.88 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000227359  hitchhiker  0.0000931266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3287  hypothetical protein  36.17 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.717112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4247  hypothetical protein  36.17 
 
 		 183 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.397141 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0548  hypothetical protein  33.54 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000220186  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3348  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000288279  decreased coverage  0.00213814 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0505  hypothetical protein  33.81 
 
 		 170 aa  90.5  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000160029  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3339  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00105383  normal  0.150558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3331  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10575  normal  0.425008 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3266  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.005885  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3255  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000006136  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3435  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0526499  hitchhiker  0.00365775 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0324  protein of unknown function DUF335 SprT  33.99 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0077532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1552  protein of unknown function DUF335, SprT  35.46 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0472621  normal  0.956048 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0501  hypothetical protein  31.45 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00000572187  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1712  protein of unknown function DUF335, SprT  35.46 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0451  hypothetical protein  53.57 
 
 		 198 aa  40.8  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1875  hypothetical protein  39.66 
 
 		 199 aa  40.8  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>