148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2936 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  731    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  65.57 
 
 		 365 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  65.56 
 
 		 361 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  64.93 
 
 		 342 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  61.43 
 
 		 369 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  63.45 
 
 		 340 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  67.33 
 
 		 319 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  67.67 
 
 		 346 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  66.33 
 
 		 341 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  64.72 
 
 		 342 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  37.86 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  41.08 
 
 		 359 aa  219  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  43.07 
 
 		 331 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  40.8 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  39.5 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  39.36 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  40.65 
 
 		 336 aa  189  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  39.16 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  37.9 
 
 		 338 aa  185  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.72 
 
 		 324 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  36.58 
 
 		 337 aa  180  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  38.85 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  40.21 
 
 		 343 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.55 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  36.22 
 
 		 337 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  36.77 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.82 
 
 		 352 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  37.82 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  36.62 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  34.23 
 
 		 354 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 338 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  34.62 
 
 		 363 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  34.82 
 
 		 342 aa  162  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  35.76 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  35.47 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  37.82 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.92 
 
 		 356 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  35.17 
 
 		 336 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  38.13 
 
 		 324 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.76 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  36.86 
 
 		 338 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  39.41 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  34.59 
 
 		 336 aa  155  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.63 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  35.29 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  35.52 
 
 		 321 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.12 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  34.69 
 
 		 353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.93 
 
 		 323 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.01 
 
 		 323 aa  146  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  34.01 
 
 		 323 aa  146  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  34.84 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  35.06 
 
 		 361 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3430  BNR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 397 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0324966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.2 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  35.81 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.91 
 
 		 322 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.26 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.26 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  32.45 
 
 		 897 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  29.9 
 
 		 335 aa  85.9  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.76 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  31.25 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  29.28 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  30.67 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  28.67 
 
 		 661 aa  76.3  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  31.36 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  29.64 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.5 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  28 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  32.84 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.39 
 
 		 321 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1178  Ycf48-like protein  28.92 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  30.22 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.97 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  28.09 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  25.74 
 
 		 742 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  34.17 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  35.06 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  34.64 
 
 		 338 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  28.08 
 
 		 698 aa  60.1  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  31.39 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  31.39 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  34.09 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0228  Ycf48-like protein  30.6 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0298  Ycf48-like protein  33.05 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0201  Ycf48-like protein  29.33 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.345386  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  29.86 
 
 		 1527 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47343  predicted protein  26.91 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0770421  hitchhiker  0.000226051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.84 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  32.09 
 
 		 340 aa  57  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  26.04 
 
 		 597 aa  57  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03191  Ycf48-like protein  35.25 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03291  Ycf48-like protein  26.71 
 
 		 337 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.307197  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  28 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.47 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03201  Ycf48-like protein  35.25 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  29.05 
 
 		 608 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>