115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2919 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  100 
 
 		 324 aa  636    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  59.56 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  59.06 
 
 		 333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  39.49 
 
 		 332 aa  199  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  35.78 
 
 		 324 aa  156  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  34.25 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  33.54 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  32.93 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  34.17 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  33.54 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  33.64 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  33.03 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  33.23 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  33.23 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  33.23 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  38.36 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  32.83 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  33.03 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  33.03 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  31.47 
 
 		 354 aa  142  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  37.12 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  31.42 
 
 		 362 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  31.5 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  32.42 
 
 		 333 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  32.93 
 
 		 336 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  35.69 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  34.2 
 
 		 304 aa  126  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  30.53 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  32.32 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  29.39 
 
 		 334 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  28.45 
 
 		 371 aa  119  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  29.19 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  33.97 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2299  general secretion pathway protein K  31.9 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  35.05 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  30 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  29.03 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2917  general secretion pathway protein K  29.97 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02831  hypothetical type II secretion protein GspK  29.91 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000902301  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3240  general secretion pathway protein GspK  32.68 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.656676  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3131  general secretion pathway protein K  32.68 
 
 		 325 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3420  general secretion pathway protein K  32.68 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  27.41 
 
 		 358 aa  102  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02781  hypothetical protein  32.28 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000553793  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  32.77 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0235  General secretion pathway protein K  30.57 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  29.57 
 
 		 336 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  35.9 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  29.3 
 
 		 321 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0322  general secretion pathway protein K  38.43 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  27.07 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  29.85 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  25.61 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  31.21 
 
 		 332 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  26.82 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  28.04 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  29.02 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  28.04 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  26.39 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  25.96 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  26.39 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  27.2 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  25.31 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  29.41 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  26.91 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  26.91 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  26.55 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4184  general secretion pathway protein K  29.85 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03183  general secretory pathway component, cryptic  31.2 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03134  hypothetical protein  31.2 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  29.03 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  40.32 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  40.32 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0381  General secretion pathway protein K  30.48 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3526  general secretion pathway protein K  30.48 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0381  general secretion pathway protein K  30.48 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.61941 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  27.43 
 
 		 577 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  25.48 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  27.94 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2389  general secretion pathway protein K  36.02 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  29.88 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  33.64 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  29.76 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  27.38 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  28.48 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  29.39 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  27.74 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  26.98 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  26.74 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  26.74 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  26.74 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  26.98 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  26.98 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  26.74 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  27.1 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  24.68 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1042  general secretion pathway protein K  28.79 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  26.39 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  26.93 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1083  general secretion pathway protein K  28.48 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>