More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2890 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_2890  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
274 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0336941  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  77.7 
 
 
278 aa  410  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  76.53 
 
 
277 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  77.26 
 
 
277 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  76.26 
 
 
278 aa  405  1e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4346  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  64.26 
 
 
262 aa  320  1e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4659  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  64.26 
 
 
262 aa  320  1e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03977  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  64.26 
 
 
262 aa  320  2e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3886  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  64.26 
 
 
262 aa  320  2e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03938  hypothetical protein  64.26 
 
 
262 aa  320  2e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4571  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  64.26 
 
 
262 aa  320  2e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3921  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  63.86 
 
 
262 aa  318  5e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5619  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  64.26 
 
 
262 aa  318  7e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0309  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  62.55 
 
 
262 aa  311  7e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.053951 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6091  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  60.54 
 
 
288 aa  300  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2964  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  61.18 
 
 
296 aa  295  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245669  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  58.17 
 
 
280 aa  295  6e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  59.84 
 
 
309 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0185  phosphonate ABC transporter ATP-binding  59.23 
 
 
293 aa  293  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4177  ATPase  56.83 
 
 
281 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0393  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  58.33 
 
 
264 aa  286  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  60.96 
 
 
284 aa  284  1e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4623  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  57.26 
 
 
269 aa  274  1e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.263735 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4524  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  57.03 
 
 
307 aa  273  2e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3859  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  54.66 
 
 
267 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3908  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  54.66 
 
 
267 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.480865 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3338  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  53.76 
 
 
307 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2593  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  53.76 
 
 
307 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1184  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  53.76 
 
 
307 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0839  ABC phophonates transporter, ATPase subunit PhnC  55.42 
 
 
301 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0851593 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3350  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  53.76 
 
 
307 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2407  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  53.76 
 
 
307 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0323  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  53.76 
 
 
307 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.558714  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3304  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  53.82 
 
 
307 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296205  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0259  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  55.47 
 
 
270 aa  265  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2203  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  48.18 
 
 
252 aa  214  1e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6355  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
264 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.424299  normal  0.5531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4432  phosphonate ABC transporter ATP-binding  47.73 
 
 
271 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3862  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  48.35 
 
 
282 aa  208  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6364  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.72 
 
 
275 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0620834  normal  0.857375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4431  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.97 
 
 
284 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319208  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1321  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  51.01 
 
 
271 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 
261 aa  205  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1322  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  48.35 
 
 
269 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.37 
 
 
282 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3324  ATPase  44.27 
 
 
275 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3709  phosphonate ABC transporter ATP-binding  45.02 
 
 
272 aa  202  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.144608 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4668  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.48 
 
 
300 aa  201  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  decreased coverage  0.000827837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5858  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  46.12 
 
 
269 aa  200  2e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0128  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.85 
 
 
257 aa  200  2e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0133  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.85 
 
 
257 aa  200  2e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.34 
 
 
270 aa  199  4e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4084  phosphonate ABC transporter ATP-binding  46.89 
 
 
274 aa  197  1e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0392209 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0278  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  46.5 
 
 
279 aa  197  1e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0928  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.98 
 
 
256 aa  197  2e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00101449  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  45.22 
 
 
261 aa  197  2e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.63104e-05  hitchhiker  2.8065e-07 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.19 
 
 
260 aa  195  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2285  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 
257 aa  195  7e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  7.78372e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2409  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  47.33 
 
 
292 aa  195  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3820  phosphonate ABC transporter ATP-binding  46.75 
 
 
270 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.693168  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0181  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.72 
 
 
252 aa  195  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4201  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  47.3 
 
 
273 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 
261 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  46.81 
 
 
269 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2920  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  47.11 
 
 
272 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3474  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 
257 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3749  phosphonate ABC transporter ATP-binding  45.83 
 
 
257 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3703  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 
257 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5251e-14 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2339  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 
257 aa  192  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  3.37848e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3440  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.89 
 
 
257 aa  191  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3745  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 
257 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0857  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.16 
 
 
264 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0840663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3391  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.89 
 
 
257 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193005  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29130  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.73 
 
 
267 aa  188  6e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3722  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
257 aa  189  6e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156195  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4787  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.08 
 
 
272 aa  188  9e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334656  normal  0.0646281 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2187  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.67 
 
 
275 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.18 
 
 
267 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2156  phosphonate ABC transporter ATP-binding  50 
 
 
253 aa  185  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  38.78 
 
 
246 aa  184  1e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3372  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.32 
 
 
257 aa  184  1e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1449  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 
254 aa  184  2e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00372903  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2286  ABC transporter related  42.86 
 
 
266 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2905  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  48.98 
 
 
273 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.217934  normal  0.0141495 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4152  ABC transporter related  42.86 
 
 
266 aa  182  4e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4575  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.8 
 
 
281 aa  182  4e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3256  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.27 
 
 
266 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485781  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0894  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.12 
 
 
275 aa  181  9e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.658454  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1927  phosphonate ABC transporter ATP-binding  42.11 
 
 
287 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2683  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.37 
 
 
286 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0052985  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1521  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
248 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  normal  0.0212059 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2677  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.05 
 
 
260 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0553597 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  40.6 
 
 
249 aa  180  2e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  44.76 
 
 
259 aa  180  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.5 
 
 
284 aa  180  3e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1097  ATPase  42.46 
 
 
254 aa  179  6e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0377  ABC transporter related  42.91 
 
 
261 aa  179  6e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.308685  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0225  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 
310 aa  178  7e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2676  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.9 
 
 
279 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2995  phosphonate ABC transporter ATP-binding  41.9 
 
 
279 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.537941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>