95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2837 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_2837  nucleotidyl transferase  100 
 
 
220 aa  451  1e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0282356  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50310  sugar nucleotidyltransferase  63.64 
 
 
220 aa  283  1e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  5.7924e-05  hitchhiker  0.000309665 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0149  hypothetical protein  41.07 
 
 
219 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0197  hypothetical protein  39.91 
 
 
219 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.950311  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2615  putative sugar nucleotidyltransferase  36.45 
 
 
208 aa  130  2e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1018  hypothetical protein  38.94 
 
 
212 aa  115  4e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  35.37 
 
 
266 aa  65.1  8e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  31.58 
 
 
246 aa  60.8  1e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  38.33 
 
 
254 aa  61.6  1e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.9 
 
 
428 aa  60.5  2e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  30.72 
 
 
237 aa  57.8  1e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  29.72 
 
 
249 aa  55.5  7e-07  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  34.19 
 
 
237 aa  54.7  1e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  24.64 
 
 
254 aa  53.9  2e-06  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  26.27 
 
 
630 aa  53.9  2e-06  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  35.83 
 
 
263 aa  53.1  3e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.82 
 
 
230 aa  53.5  3e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  31.48 
 
 
250 aa  52.8  4e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0016  transferase, putative  41.3 
 
 
263 aa  51.6  9e-06  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  35.59 
 
 
436 aa  51.2  1e-05  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  33.62 
 
 
256 aa  51.2  1e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  31.15 
 
 
244 aa  50.4  2e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  25.81 
 
 
261 aa  49.7  3e-05  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  24.58 
 
 
616 aa  50.1  3e-05  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.76 
 
 
225 aa  48.5  7e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  25.49 
 
 
414 aa  48.9  7e-05  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1289  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.9 
 
 
474 aa  48.5  8e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  27.05 
 
 
393 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  32.38 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  31.78 
 
 
522 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  32.38 
 
 
227 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
272 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  28.65 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  33.88 
 
 
256 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  32.69 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0053  nucleotidyltransferase protein  31.36 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  26.23 
 
 
253 aa  45.8  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6661  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  49.09 
 
 
483 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1575  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.94 
 
 
247 aa  45.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00205775  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  31.03 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  26.13 
 
 
411 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1181  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25.62 
 
 
455 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.60432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2079  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  32.82 
 
 
462 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1802  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  34.21 
 
 
452 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0602  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  39.34 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501515  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  27.12 
 
 
247 aa  44.3  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0588  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.1 
 
 
455 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  30.23 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  27.08 
 
 
383 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  26.62 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  27.54 
 
 
300 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  1.94318e-05 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
287 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1786  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  43.48 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2156  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  25 
 
 
284 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103294  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  27.27 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  27.37 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0238  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  29.92 
 
 
408 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1239  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  34.78 
 
 
263 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0490537  hitchhiker  8.06727e-11 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  35.23 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  31.09 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  27.32 
 
 
241 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  29.46 
 
 
388 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  26.7 
 
 
240 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  26.04 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
271 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  23.44 
 
 
253 aa  42.7  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  24.79 
 
 
263 aa  42.7  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06371  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.07 
 
 
449 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  26.13 
 
 
411 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2755  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  36.23 
 
 
253 aa  42.4  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.312562  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  31.4 
 
 
260 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  29.75 
 
 
393 aa  42.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3985  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  33.94 
 
 
241 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.755294 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2448  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  30.33 
 
 
453 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.420996  hitchhiker  1.46766e-07 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4068  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.19 
 
 
488 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  27.35 
 
 
592 aa  42  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  31.78 
 
 
254 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  32.69 
 
 
239 aa  42  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  32.69 
 
 
232 aa  42  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4101  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.19 
 
 
488 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  22.5 
 
 
411 aa  42  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0883  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  50 
 
 
209 aa  41.6  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2867  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  32.88 
 
 
466 aa  41.6  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  31.09 
 
 
255 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  32.43 
 
 
255 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0043  nucleotidyl transferase  39.19 
 
 
227 aa  41.6  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3134  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  34.29 
 
 
263 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.251899  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  31.09 
 
 
255 aa  41.6  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  43.86 
 
 
252 aa  41.6  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  28.74 
 
 
253 aa  41.6  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2323  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.31 
 
 
462 aa  41.6  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.845918  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  32.43 
 
 
255 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  31.09 
 
 
255 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  32.43 
 
 
255 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  32.43 
 
 
255 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>