More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2802 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  58.03 
 
 		 751 aa  829    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  64.55 
 
 		 745 aa  891    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  59.53 
 
 		 744 aa  822    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  77.07 
 
 		 747 aa  1047    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  58.56 
 
 		 747 aa  817    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  57.67 
 
 		 785 aa  810    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  58.06 
 
 		 714 aa  797    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  57.05 
 
 		 758 aa  806    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  77.56 
 
 		 748 aa  1050    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 737 aa  1469    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  58.19 
 
 		 747 aa  803    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  78.97 
 
 		 758 aa  1068    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  77.2 
 
 		 747 aa  1059    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  59.18 
 
 		 746 aa  803    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  76.09 
 
 		 754 aa  1037    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  57.8 
 
 		 746 aa  798    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  53.59 
 
 		 715 aa  678    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  58.08 
 
 		 741 aa  828    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  61.54 
 
 		 691 aa  785    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  64.13 
 
 		 767 aa  911    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  63.1 
 
 		 738 aa  657    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  59.79 
 
 		 744 aa  805    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  58.19 
 
 		 734 aa  794    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  79.89 
 
 		 739 aa  1067    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  78.71 
 
 		 743 aa  1086    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  48.98 
 
 		 739 aa  650    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  55.31 
 
 		 754 aa  789    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  59.2 
 
 		 760 aa  832    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  57.87 
 
 		 762 aa  805    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  53.63 
 
 		 734 aa  728    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  58.44 
 
 		 736 aa  829    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  51.8 
 
 		 719 aa  697    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  77.69 
 
 		 753 aa  1039    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  58.65 
 
 		 762 aa  803    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  58.12 
 
 		 733 aa  818    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  61.03 
 
 		 723 aa  856    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  57.39 
 
 		 741 aa  811    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  58.13 
 
 		 759 aa  815    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  59.21 
 
 		 733 aa  805    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  63.71 
 
 		 709 aa  866    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  77.41 
 
 		 748 aa  1038    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  49.45 
 
 		 650 aa  630  1e-179  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 770 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  52.99 
 
 		 614 aa  455  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  36.2 
 
 		 803 aa  443  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  56.8 
 
 		 552 aa  420  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  56.8 
 
 		 552 aa  420  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 687 aa  414  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  45.55 
 
 		 785 aa  397  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 695 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 691 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  43.7 
 
 		 783 aa  387  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  47.52 
 
 		 701 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  43.93 
 
 		 601 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  44.68 
 
 		 770 aa  380  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  41.18 
 
 		 774 aa  381  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 		 604 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  44.7 
 
 		 598 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  45.15 
 
 		 769 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  46.32 
 
 		 603 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  44.92 
 
 		 769 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  46.31 
 
 		 681 aa  376  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  45.15 
 
 		 769 aa  375  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  41.12 
 
 		 610 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  45.18 
 
 		 696 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  46.15 
 
 		 639 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  46.78 
 
 		 606 aa  372  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  45.37 
 
 		 770 aa  372  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 652 aa  366  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 		 694 aa  364  3e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  45.48 
 
 		 607 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 697 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 670 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  44.99 
 
 		 677 aa  356  8.999999999999999e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  33.69 
 
 		 681 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  34.37 
 
 		 729 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  32.13 
 
 		 692 aa  354  4e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 724 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  34.46 
 
 		 669 aa  352  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  34.27 
 
 		 704 aa  352  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  33.96 
 
 		 674 aa  350  5e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 701 aa  347  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  33.97 
 
 		 662 aa  345  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 		 666 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 686 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 728 aa  344  4e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 		 671 aa  343  7e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  44.85 
 
 		 673 aa  342  1e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  33.42 
 
 		 702 aa  342  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  33.6 
 
 		 715 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  33.99 
 
 		 736 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 673 aa  340  8e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 674 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 690 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3221  CheA signal transduction histidine kinase  43.94 
 
 		 635 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 688 aa  337  5e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  33.88 
 
 		 655 aa  337  5.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  33.77 
 
 		 736 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 660 aa  336  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 		 713 aa  335  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>