More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2714 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  100 
 
 
425 aa  843    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1899  folylpolyglutamate synthetase  74.23 
 
 
435 aa  600  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  72.94 
 
 
435 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  72 
 
 
436 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  74.23 
 
 
429 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  73.41 
 
 
435 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1558  FolC bifunctional protein  72.47 
 
 
428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  0.124911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2022  folylpolyglutamate synthetase  74.41 
 
 
429 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  69.74 
 
 
434 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  69.5 
 
 
434 aa  554  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34180  Folylpolyglutamate synthetase protein  71.39 
 
 
433 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  47.39 
 
 
422 aa  352  7e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  48.21 
 
 
422 aa  349  5e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  48.24 
 
 
422 aa  347  2e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0809  FolC bifunctional protein  48.83 
 
 
423 aa  347  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0844236 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  47.87 
 
 
422 aa  345  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  43.81 
 
 
426 aa  342  5e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02507  folylpolyglutamate synthase; dihydrofolate synthase  50.23 
 
 
432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2864  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  47 
 
 
422 aa  339  5e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1371  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  48.93 
 
 
422 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.968541  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0880  folylpolyglutamate synthase  43.58 
 
 
443 aa  336  5.999999999999999e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0202612  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  46.62 
 
 
422 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  45.85 
 
 
434 aa  335  7.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  45.85 
 
 
434 aa  335  9e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2693  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  46.62 
 
 
422 aa  335  9e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  45.85 
 
 
434 aa  335  9e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  46.62 
 
 
422 aa  335  9e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.887259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3331  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  47.96 
 
 
420 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0040495  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0902  FolC bifunctional protein  47.18 
 
 
432 aa  335  1e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1026  dihydrofolate synthase  47.49 
 
 
432 aa  335  1e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  46.62 
 
 
422 aa  334  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02240  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  46.62 
 
 
422 aa  333  4e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1341  FolC bifunctional protein  46.62 
 
 
422 aa  333  4e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420522  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2466  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  46.62 
 
 
422 aa  333  4e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02200  hypothetical protein  46.62 
 
 
422 aa  333  4e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  44.68 
 
 
421 aa  333  5e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  46.14 
 
 
422 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3455  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  46.14 
 
 
422 aa  330  3e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2607  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  45.89 
 
 
422 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0948083  normal  0.269404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  45.89 
 
 
422 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002876  dihydrofolate synthase/folylpolyglutamate synthase  43.65 
 
 
420 aa  329  7e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.394624  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  45.89 
 
 
422 aa  329  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  45.65 
 
 
422 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  43.31 
 
 
406 aa  324  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  42.65 
 
 
425 aa  323  3e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1264  FolC bifunctional protein  46.39 
 
 
437 aa  319  5e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0683  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  45.84 
 
 
437 aa  319  6e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.944672  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  43.87 
 
 
431 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  45.02 
 
 
432 aa  317  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1968  FolC bifunctional protein  40.8 
 
 
428 aa  316  4e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.843796 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0873  folylpolyglutamate synthetase  45.56 
 
 
436 aa  315  9e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0218133 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3059  FolC bifunctional protein  45.18 
 
 
437 aa  315  9e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310579  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1717  FolC bifunctional protein  44.94 
 
 
437 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0765  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  44.94 
 
 
447 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1653  FolC bifunctional protein  44.94 
 
 
461 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2303  FolC bifunctional protein  44.94 
 
 
455 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.966782  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  44.34 
 
 
430 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1862  FolC bifunctional protein  44.94 
 
 
461 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.59484  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2441  FolC bifunctional protein  44.94 
 
 
437 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189653  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0533  FolC bifunctional protein  44.94 
 
 
461 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0775  FolC bifunctional protein  44.32 
 
 
441 aa  311  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183365  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  43.96 
 
 
421 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  42.86 
 
 
423 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  48 
 
 
448 aa  310  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  43.83 
 
 
421 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4618  FolC bifunctional protein  43.67 
 
 
436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653087  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2045  FolC bifunctional protein  40.51 
 
 
418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0860305  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  42.38 
 
 
423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0366  dihydrofolate:folylpolyglutamate synthetase  45.22 
 
 
426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  42.55 
 
 
421 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  42.14 
 
 
423 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3566  FolC bifunctional protein  42.99 
 
 
436 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960741  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4405  FolC bifunctional protein  42.99 
 
 
436 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137077  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3962  FolC bifunctional protein  42.99 
 
 
436 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  43.3 
 
 
425 aa  302  9e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2121  folylpolyglutamate synthetase  42.76 
 
 
436 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700041  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2877  folylpolyglutamate synthetase  43.58 
 
 
436 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.971694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  42.51 
 
 
432 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1023  folylpolyglutamate synthetase  42.38 
 
 
432 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  41.9 
 
 
423 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  41.67 
 
 
423 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1046  FolC bifunctional protein  44.77 
 
 
411 aa  299  7e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.777875 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  43.45 
 
 
442 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3857  FolC bifunctional protein  42.99 
 
 
436 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3352  FolC bifunctional protein  42.99 
 
 
436 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.269104  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  41.85 
 
 
431 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1487  FolC bifunctional protein  42.72 
 
 
448 aa  296  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152366  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  41.59 
 
 
432 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  41.55 
 
 
432 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1979  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  43.46 
 
 
432 aa  295  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1295  hypothetical protein  40.38 
 
 
428 aa  295  9e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1296  hypothetical protein  40.62 
 
 
428 aa  293  3e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4378  FolC bifunctional protein  44.27 
 
 
436 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6838  FolC bifunctional protein  44.04 
 
 
436 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  43.3 
 
 
437 aa  292  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  50.46 
 
 
386 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0958  dihydrofolate synthase  38.3 
 
 
416 aa  290  4e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  42.72 
 
 
421 aa  290  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1606  FolC bifunctional protein  41.06 
 
 
426 aa  290  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2302  folylpolyglutamate synthetase  42.56 
 
 
436 aa  289  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>