64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2553 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2553  acetyltransferase-like protein  100 
 
 		 94 aa  196  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000305824  hitchhiker  0.000000000000131346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1764  hypothetical protein  80.65 
 
 		 93 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000155918  hitchhiker  0.000000000000406701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2323  hypothetical protein  80.65 
 
 		 143 aa  156  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000526442  hitchhiker  0.0000374352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3447  hypothetical protein  80.65 
 
 		 93 aa  156  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030181  hitchhiker  0.000684662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1924  hypothetical protein  80.65 
 
 		 93 aa  156  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000705286  hitchhiker  0.00000000000000488804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3559  hypothetical protein  79.57 
 
 		 94 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4010  hypothetical protein  82.95 
 
 		 115 aa  151  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057579  normal  0.556915 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41930  hypothetical protein  78.49 
 
 		 161 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23120  hypothetical protein  77.91 
 
 		 90 aa  137  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000670372  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  68.82 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000180646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  68.82 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000410313  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0079  hypothetical protein  41.25 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0085  hypothetical protein  38.75 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0083  hypothetical protein  38.75 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0065  hypothetical protein  38.75 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0082  hypothetical protein  38.75 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0080  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  35.16 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0084  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  43.04 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  36.36 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  40.7 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0079  hypothetical protein  37.18 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  35.63 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  35.23 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  35.23 
 
 		 97 aa  62  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3774  acetyltransferase-like  35.9 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.463282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3969  hypothetical protein  35.8 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  32.18 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0071  hypothetical protein  34.62 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4457  hypothetical protein  32.93 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.919934 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4858  hypothetical protein  32.91 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  40.26 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4184  hypothetical protein  34.78 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  33.72 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  27.71 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  41.46 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  34.09 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05101  acetyltransferase  28.75 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3439  acetyltransferase  31.71 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  32.22 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  37.33 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001234  predicted acetyltransferase  36.92 
 
 		 91 aa  47.4  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546036  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0562  hypothetical protein  32.93 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0844  hypothetical protein  26.83 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3334  putative acetyltransferase protein  28.95 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.474868 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3553  hypothetical protein  31.65 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  29.63 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2603  hypothetical protein  30.43 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1912  hypothetical protein  34.25 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00117595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  32.05 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2744  acetyltransferase-like  32.1 
 
 		 377 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3077  putative acetyltransferase protein  29.58 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.402192 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  32.05 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  28.75 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  31.58 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  26.15 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  27.03 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4762  acetyltransferase-like protein  24.44 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2302  acetyltransferase-like protein  29.63 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367089  hitchhiker  0.00188481 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0481  acetyltransferase  26.19 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2928  acetyltransferase-like protein  30.59 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408165 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2082  acetyltransferase  24.71 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>