More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2451 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_2451  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
655 aa  1249    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.932747 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43220  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  52.73 
 
 
652 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4192  chemotaxis sensory transducer  52.93 
 
 
654 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1819  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.13 
 
 
646 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3892  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.98 
 
 
646 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.176231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.67 
 
 
646 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.4 
 
 
646 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0815522  normal  0.369158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  44.39 
 
 
647 aa  351  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 
640 aa  347  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.58 
 
 
638 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.82 
 
 
638 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.82 
 
 
650 aa  332  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.82 
 
 
638 aa  331  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  50.38 
 
 
642 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  49.62 
 
 
642 aa  330  6e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  52.91 
 
 
629 aa  329  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.22 
 
 
638 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.25 
 
 
639 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  44.06 
 
 
647 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.86 
 
 
647 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  53.03 
 
 
640 aa  317  4e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.31 
 
 
638 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.7 
 
 
739 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.39 
 
 
647 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  53.45 
 
 
640 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.86 
 
 
647 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  53.39 
 
 
681 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  50.73 
 
 
619 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5159  methyl-accepting chemotaxis protein  38.46 
 
 
638 aa  308  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  50.73 
 
 
633 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  52.65 
 
 
676 aa  306  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  53.5 
 
 
647 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  54.88 
 
 
647 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  52.99 
 
 
639 aa  297  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.71 
 
 
639 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.71 
 
 
639 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.41 
 
 
639 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1539  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  49.71 
 
 
626 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206608  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.81 
 
 
639 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0378  chemotaxis sensory transducer  42.13 
 
 
638 aa  281  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68857  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.3 
 
 
634 aa  270  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.13 
 
 
522 aa  270  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  43.72 
 
 
541 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.05 
 
 
544 aa  262  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.13 
 
 
541 aa  260  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.06 
 
 
632 aa  259  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.31 
 
 
716 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.57 
 
 
541 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.79 
 
 
425 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.4 
 
 
285 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.553976  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  43.02 
 
 
541 aa  253  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.31 
 
 
624 aa  253  7e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  43.97 
 
 
541 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.04 
 
 
636 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44 
 
 
541 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.14 
 
 
541 aa  251  4e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.37 
 
 
637 aa  251  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.48 
 
 
523 aa  249  9e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.76 
 
 
679 aa  249  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.69 
 
 
541 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  44.38 
 
 
546 aa  246  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  41.41 
 
 
712 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.04 
 
 
674 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.77 
 
 
638 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  38.57 
 
 
713 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.58 
 
 
555 aa  244  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  45.9 
 
 
541 aa  244  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  41.13 
 
 
712 aa  244  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.83 
 
 
547 aa  243  9e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.49 
 
 
541 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.58 
 
 
541 aa  242  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.13 
 
 
570 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.63 
 
 
637 aa  241  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  45.65 
 
 
545 aa  240  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  40.55 
 
 
541 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.02 
 
 
492 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.6 
 
 
539 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.19 
 
 
542 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4141  chemotaxis transducer  42.73 
 
 
541 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  43.6 
 
 
539 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.63 
 
 
543 aa  236  7e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.14 
 
 
541 aa  236  9e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4022  chemotaxis sensory transducer  43.18 
 
 
493 aa  236  9e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.39 
 
 
541 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  38.83 
 
 
546 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  43.75 
 
 
541 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.1 
 
 
541 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.14 
 
 
568 aa  234  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.59 
 
 
541 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.39 
 
 
541 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.36 
 
 
560 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  44.04 
 
 
541 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 
541 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  40.87 
 
 
541 aa  233  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  43.14 
 
 
541 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.36 
 
 
489 aa  233  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00221824  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.18 
 
 
492 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178377  decreased coverage  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2398  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.59 
 
 
656 aa  232  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.201842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1912  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.9 
 
 
492 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.407863  hitchhiker  0.000000143908 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  37.89 
 
 
695 aa  232  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>