270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2441 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  100 
 
 		 144 aa  279  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  68.75 
 
 		 144 aa  201  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  67.36 
 
 		 144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  68.53 
 
 		 148 aa  194  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  67.61 
 
 		 149 aa  192  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  63.89 
 
 		 149 aa  191  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  69.93 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  65.73 
 
 		 148 aa  190  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  65.73 
 
 		 151 aa  190  7e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  66.2 
 
 		 147 aa  188  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  66.9 
 
 		 149 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  69.44 
 
 		 144 aa  183  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  66.43 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  65.73 
 
 		 145 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  65.73 
 
 		 145 aa  173  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  68.06 
 
 		 144 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  65.47 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  63.64 
 
 		 147 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  63.64 
 
 		 147 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  63.64 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  66.91 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  61.97 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  61.54 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  62.07 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  70.14 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  63.31 
 
 		 147 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  62.59 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  60.42 
 
 		 148 aa  157  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  60.43 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  60.43 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  60.43 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  59.71 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  55.4 
 
 		 149 aa  143  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  55.63 
 
 		 150 aa  140  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  54.23 
 
 		 150 aa  135  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  62.32 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  46.56 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  41.1 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  41.5 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5508  hypothetical protein  51.85 
 
 		 128 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  unclonable  3.38736e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5443  hypothetical protein  51.85 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000785742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  45.97 
 
 		 171 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5446  hypothetical protein  50.93 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5170  hypothetical protein  50.93 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5004  hypothetical protein  50.93 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.91746e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5020  hypothetical protein  50.93 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  50.93 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5564  hypothetical protein  50.93 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5499  hypothetical protein  50.93 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5412  hypothetical protein  50.93 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.745190000000001e-63 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  43.75 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  44.35 
 
 		 174 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3842  DoxX family protein  49.11 
 
 		 128 aa  90.1  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000608334  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  44.03 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  41.78 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  45.97 
 
 		 173 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  45.97 
 
 		 173 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  45.97 
 
 		 173 aa  87.4  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  42.74 
 
 		 173 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  35.37 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0412  DoxX family protein  45.53 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  39.84 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0907  DoxX  55.56 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  39.2 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  40.88 
 
 		 378 aa  77.4  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  36.81 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  44.72 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  44.88 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  39.84 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  40.32 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2663  DoxX family protein  57.38 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0368307  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  38.58 
 
 		 177 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1048  DoxX  38.84 
 
 		 178 aa  72  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.083791  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  41.94 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  39.13 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  39.2 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  42.5 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  37.8 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  37.8 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  37.9 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  37.3 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  42.4 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3911  DoxX family protein  45.87 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  34.48 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  39.16 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  39.5 
 
 		 161 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  40 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  31.91 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  31.13 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  36.15 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  40.34 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  40.34 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  36.8 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  38.61 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  36.23 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  31.21 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  30.5 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  34.38 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  33.33 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3466  DoxX family protein  34.65 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>