40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2435 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 214 aa  434  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272876  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3648  acetyltransferase  75.6 
 
 		 216 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28870  GCN5-related N-acetyltransferase  69.86 
 
 		 223 aa  321  6e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.114287  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2748  hypothetical protein  66.82 
 
 		 223 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2477  hypothetical protein  67.3 
 
 		 223 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184959  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31660  hypothetical protein  69.61 
 
 		 237 aa  305  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.286419 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  68.75 
 
 		 216 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2891  acetyltransferase  68.75 
 
 		 225 aa  304  7e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00698581  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2891  GCN5-related N-acetyltransferase  68.27 
 
 		 216 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0118501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2693  hypothetical protein  70.2 
 
 		 210 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  63.43 
 
 		 216 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  43 
 
 		 223 aa  187  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03041  predicted acetyltransferase, GNAT family  32.6 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3529  hypothetical protein  30.77 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3188  hypothetical protein  30.39 
 
 		 214 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  28.88 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2655  GCN5-related N-acetyltransferase  29.32 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  29.32 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1335  GCN5-related N-acetyltransferase  27.23 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1614  acetyltransferase  28.8 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  28.8 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1255  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1431  GCN5-related N-acetyltransferase  28.27 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1467  GCN5-related N-acetyltransferase  28.27 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1437  GCN5-related N-acetyltransferase  27.75 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3294  GCN5-related N-acetyltransferase  28.88 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000278112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2722  GCN5-related N-acetyltransferase  28.8 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1126  acetyltransferase  27.89 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2896  GCN5-related N-acetyltransferase  28.88 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.289244  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2648  GCN5-related N-acetyltransferase  29.84 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3173  GCN5-related N-acetyltransferase  28.34 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7239  GCN5-related N-acetyltransferase  26.59 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343936  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1149  GCN5-related N-acetyltransferase  25.12 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  36.9 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0677  acetyltransferase  19.02 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  21.43 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0869  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 		 145 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4097  GCN5-related N-acetyltransferase  30.68 
 
 		 200 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 		 213 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>