More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2363 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0222  DszA family monooxygenase  75.72 
 
 		 461 aa  708    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0424148  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5186  monooxygenase, DszA family  74.83 
 
 		 452 aa  706    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0352  DszA family monooxygenase  76.16 
 
 		 452 aa  713    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895998  normal  0.798866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0238  DszA family monooxygenase  73.09 
 
 		 454 aa  683    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0246  monooxygenase  75.5 
 
 		 463 aa  710    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31500  Flavin-dependent oxidoreductase  74.57 
 
 		 463 aa  707    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34290  DszA family monooxygenase  73.11 
 
 		 462 aa  681    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0671328  normal  0.0164622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4990  monooxygenase  73.49 
 
 		 464 aa  709    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0237  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  75.06 
 
 		 461 aa  702    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.782934  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2363  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  100 
 
 		 467 aa  959    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000880106  hitchhiker  0.00124341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2914  hypothetical protein  72.89 
 
 		 462 aa  679    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1906  DszA family monooxygenase  66.37 
 
 		 457 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1543  DszA family monooxygenase  66.29 
 
 		 456 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.9269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5152  nitrilotriacetate monooxygenase  63.78 
 
 		 454 aa  620  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669149  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4930  flavin-dependent oxidoreductase  62.95 
 
 		 470 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497416  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3028  flavin-dependent oxidoreductase  62.95 
 
 		 470 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0660648  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5338  flavin-dependent oxidoreductase  62.95 
 
 		 470 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4688  flavin-dependent oxidoreductase  62.53 
 
 		 472 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0991712  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5217  flavin-dependent oxidoreductase  62.31 
 
 		 472 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.668453 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0310  flavin-dependent oxidoreductase  62.31 
 
 		 470 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3392  flavin-dependent oxidoreductase  61.86 
 
 		 465 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4229  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  64.35 
 
 		 469 aa  568  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1440  monoxygenase  60.53 
 
 		 464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1866  monoxygenase  60.31 
 
 		 464 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0384468  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0857  hypothetical protein  60.53 
 
 		 472 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0545  hypothetical protein  60.31 
 
 		 472 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2173  monoxygenase  60.53 
 
 		 464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.417795  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0447  hypothetical protein  60.31 
 
 		 472 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1776  DszA family monooxygenase  59.47 
 
 		 454 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4538  flavin-dependent oxidoreductase  60.09 
 
 		 468 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2573  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  62.19 
 
 		 478 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.210511 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2085  monoxygenase  60.53 
 
 		 464 aa  557  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5029  flavin-dependent oxidoreductase  57.43 
 
 		 463 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.283856 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6097  putative monooxygenase protein  56.32 
 
 		 452 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.97832  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2869  xenobiotic compound monooxygenase  53.1 
 
 		 466 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.927289  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34540  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  54.42 
 
 		 469 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.748973  normal  0.0562583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2933  hypothetical protein  54.42 
 
 		 469 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2984  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family  53.98 
 
 		 466 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0528073  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1146  monoxygenase  54.2 
 
 		 467 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948118  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0931  monoxygenase  54.2 
 
 		 467 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1520  monoxygenase  54.2 
 
 		 467 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148632  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1016  monoxygenase  53.98 
 
 		 467 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0093  monoxygenase  54.2 
 
 		 467 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3195  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  53.86 
 
 		 454 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2257  monoxygenase  53.76 
 
 		 467 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6145  DszA family monooxygenase  54.08 
 
 		 465 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453092  hitchhiker  0.00590526 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6510  putative monooxygenase protein  54.1 
 
 		 452 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43810  monoxygenase, NtaA/DszA family  52.88 
 
 		 467 aa  504  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29629  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02460  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  54 
 
 		 473 aa  499  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230038  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1741  monoxygenase  54.2 
 
 		 467 aa  501  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6560  putative monooxygenase protein, DszA family  52.99 
 
 		 465 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176413  normal  0.397515 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2052  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  52.98 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2746  hypothetical protein  52.88 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0157125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3007  hypothetical protein  52.43 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.40837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1590  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  55.85 
 
 		 460 aa  497  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3529  monooxygenase, putative  55.13 
 
 		 454 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1560  FMNH2-dependent monooxygenase  50.99 
 
 		 461 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2244  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  54.91 
 
 		 463 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2397  monoxygenase  54.91 
 
 		 463 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.661365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1120  hypothetical protein  52.43 
 
 		 461 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0891  putative monooxygenase  53.67 
 
 		 480 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0908  putative monooxygenase  53.67 
 
 		 480 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0897  putative monooxygenase  53.45 
 
 		 480 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125634  normal  0.0455418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4846  hypothetical protein  53.88 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5154  nitrilotriacetate monooxygenase  49.03 
 
 		 467 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866117  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3798  putative monooxygenase  50.67 
 
 		 467 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.438268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3872  putative monooxygenase  50.44 
 
 		 467 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0559897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3490  putative monooxygenase  50.67 
 
 		 467 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1129  hypothetical protein  51.44 
 
 		 468 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7155  nitrilotriacetate monooxygenase  49.11 
 
 		 468 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2670  hypothetical protein  51.66 
 
 		 457 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4860  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  51.91 
 
 		 469 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.06917  normal  0.729737 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6108  putative monooxygenase  50.44 
 
 		 469 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1591  hypothetical protein  51.44 
 
 		 457 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.176548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2543  putative monooxygenase  49.43 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  0.2652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3462  monoxygenase  47.91 
 
 		 460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0705308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1591  monoxygenase  50.11 
 
 		 483 aa  449  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7501  flavin-dependent oxidoreductase-like  49.11 
 
 		 466 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180408  normal  0.269687 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6340  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  49.56 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6517  flavin-dependent oxidoreductase-like  49.78 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6751  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  49.78 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0288588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4268  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  46.92 
 
 		 462 aa  438  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.375018  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09004  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17580)  45.89 
 
 		 482 aa  414  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3997  monooxygenase  48.32 
 
 		 459 aa  413  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.784522  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02576  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_3G15040)  46.1 
 
 		 481 aa  409  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.285559 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02320  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_6G01920)  42.05 
 
 		 486 aa  392  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1792  monooxygenase  46.78 
 
 		 460 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5216  nitrilotriacetate monooxygenase  42.44 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2175  hypothetical protein  45.98 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45532  predicted protein  39.91 
 
 		 505 aa  360  3e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43740  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  42.86 
 
 		 452 aa  358  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0096  hypothetical protein  43.08 
 
 		 458 aa  350  2e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3646  putative monooxygenase, DszA family  42.64 
 
 		 460 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2534  putative flavin-dependent oxidoreductase  42.98 
 
 		 458 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2169  putative monooxygenase  43.11 
 
 		 493 aa  346  6e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6178  hypothetical protein  41.07 
 
 		 460 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1259  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.91 
 
 		 460 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860986  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6573  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductases-like protein  39.91 
 
 		 460 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.265801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36305  predicted protein  40.22 
 
 		 507 aa  341  1e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.412413  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2800  hypothetical protein  41.34 
 
 		 457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>