18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2335 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2335  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  100 
 
 		 345 aa  695    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00405525  normal  0.0104415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0172  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  76.9 
 
 		 345 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01190  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  76.68 
 
 		 345 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.221969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0539  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  56.8 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2438  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  42.35 
 
 		 354 aa  212  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.091366  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3113  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  34.94 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484241  normal  0.133008 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3468  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  34.64 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3181  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  29.94 
 
 		 347 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3168  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  28.36 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3482  hypothetical protein  25.57 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.218569 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3787  hypothetical protein  24.74 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2739  hypothetical protein  30.49 
 
 		 399 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0361199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0287  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  26.63 
 
 		 378 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3386  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  25 
 
 		 351 aa  46.6  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2828  hypothetical protein  26.54 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0866  Beta-ketoacyl synthase  25.26 
 
 		 410 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3012  hypothetical protein  30.77 
 
 		 329 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4077  hypothetical protein  27.06 
 
 		 395 aa  42.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000344983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>