More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2314 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  100 
 
 
243 aa  490  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  70.66 
 
 
242 aa  345  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  69.83 
 
 
242 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  46.47 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  46.89 
 
 
256 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  46.58 
 
 
256 aa  201  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  45.87 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  43.28 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  43.4 
 
 
242 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  42.86 
 
 
242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  42.55 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.4 
 
 
239 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  41.35 
 
 
264 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5576  protein serine/threonine phosphatase  43.83 
 
 
242 aa  174  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  41.53 
 
 
267 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.5 
 
 
242 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  40.52 
 
 
270 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  40.17 
 
 
276 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  39.91 
 
 
262 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  37.28 
 
 
255 aa  159  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  39.74 
 
 
236 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  40.68 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1520  putative phosphoprotein phosphatase  35.32 
 
 
241 aa  146  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.101947 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  39.04 
 
 
394 aa  146  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 
467 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  39.41 
 
 
234 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  42.53 
 
 
248 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  39.47 
 
 
469 aa  142  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  40.85 
 
 
472 aa  141  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  38.2 
 
 
238 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  33.89 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  38.7 
 
 
425 aa  139  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2458  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.75 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  39.13 
 
 
421 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3136  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.18 
 
 
251 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  37.55 
 
 
463 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  35.06 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.86 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  36.25 
 
 
419 aa  135  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  38.16 
 
 
452 aa  135  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  37.39 
 
 
239 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  39.17 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  34.62 
 
 
449 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  36.4 
 
 
395 aa  132  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  34.29 
 
 
276 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.92 
 
 
241 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  38.72 
 
 
265 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  35.93 
 
 
320 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  38.52 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  39.41 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  36.86 
 
 
264 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  37.61 
 
 
426 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  31.89 
 
 
417 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20950  serine/threonine protein phosphatase, 2C-like protein  36.73 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0398622  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  35.29 
 
 
519 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  34.8 
 
 
548 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  36.21 
 
 
478 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3183  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.96 
 
 
274 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.07989  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  28.57 
 
 
273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  33.61 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  34.3 
 
 
538 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  34.76 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  37.34 
 
 
441 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  40.17 
 
 
348 aa  126  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  36.29 
 
 
540 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.88 
 
 
247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  30.77 
 
 
241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  37.87 
 
 
239 aa  125  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  36.36 
 
 
463 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.34 
 
 
482 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  36.64 
 
 
474 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  34.87 
 
 
258 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5885  protein serine/threonine phosphatase  35.41 
 
 
259 aa  122  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.29 
 
 
239 aa  122  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  33.88 
 
 
445 aa  122  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00248  phosphoprotein phosphatase  35.38 
 
 
216 aa  122  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  38.56 
 
 
466 aa  122  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  35.56 
 
 
364 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  34.73 
 
 
296 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  36.21 
 
 
386 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  33.77 
 
 
505 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  33.07 
 
 
574 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.95 
 
 
611 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  34.31 
 
 
554 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  29.31 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  34.82 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  37.02 
 
 
259 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0544  protein serine/threonine phosphatases  32.54 
 
 
291 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  35.27 
 
 
474 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  35.17 
 
 
422 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  37.4 
 
 
253 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.27 
 
 
438 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  32.91 
 
 
236 aa  118  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0438  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.13 
 
 
287 aa  118  7.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285486  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  36.05 
 
 
323 aa  118  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  35.06 
 
 
305 aa  118  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  34.19 
 
 
462 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  37.72 
 
 
381 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2294  Phosphoprotein phosphatase  34.75 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  34.53 
 
 
478 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>