More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2312 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_2312  ABC transporter related  100 
 
 
234 aa  447  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  hitchhiker  0.0000468431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0144  ABC transporter ATP-binding protein  64.71 
 
 
239 aa  251  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00860  putative ATP-binding component of ABC transporter  64.71 
 
 
239 aa  251  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000878092  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1841  ABC transporter, ATP-binding protein  54.59 
 
 
238 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.551478  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1669  ABC transporter related  52.11 
 
 
251 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52030  ATP binding component of ABC transporter  45.65 
 
 
238 aa  166  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1317  ABC transporter related  44.58 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2628  ABC transporter  45.93 
 
 
230 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166504  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4235  ABC transporter related  40.53 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2875  ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0026509  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0466  ABC transporter related protein  41.47 
 
 
222 aa  143  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3150  ABC transporter component  43.87 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0901  ABC transporter related  42.4 
 
 
241 aa  138  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.69974  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  44.27 
 
 
223 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  44.27 
 
 
223 aa  135  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 
237 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  44.27 
 
 
223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3220  ABC transporter related  47.96 
 
 
213 aa  135  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3107  ABC transporter related  40 
 
 
224 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000083288  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60790  ABC transporter ATP-binding protein  41.74 
 
 
228 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 
223 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  45.3 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  39.58 
 
 
244 aa  126  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  39.71 
 
 
214 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  42.78 
 
 
236 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  42.78 
 
 
236 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  42.78 
 
 
236 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  42.78 
 
 
236 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  35.51 
 
 
225 aa  123  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4056  hypothetical protein  43.84 
 
 
244 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0200759  normal  0.24116 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  35.51 
 
 
225 aa  123  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  41.45 
 
 
233 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 
250 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 
236 aa  122  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  40.84 
 
 
223 aa  122  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  35.51 
 
 
640 aa  122  4e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  41.18 
 
 
235 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  43 
 
 
217 aa  121  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  39.52 
 
 
225 aa  121  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1004  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  43.39 
 
 
225 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  35.94 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  35.48 
 
 
643 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  41.94 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2175  ABC transporter related protein  43.68 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2162  ABC transporter, ATP-binding protein  36.22 
 
 
255 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.754182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2420  ABC transporter, ATP-binding protein  36.22 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.658909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4643  ABC transporter ATP-binding protein  36.76 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2306  ABC transporter related  37.32 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000206589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4478  ABC transporter, ATP-binding protein  36.76 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4496  ABC transporter, ATP-binding protein  36.76 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4867  ABC transporter, ATP-binding protein  36.76 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4997  ABC transporter ATP-binding protein  36.76 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2110  ABC transporter related protein  39.09 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  39.69 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  41.15 
 
 
233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2146  ABC transporter, ATP-binding protein  36.22 
 
 
255 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.278232  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  41.4 
 
 
229 aa  119  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  40.78 
 
 
247 aa  119  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2490  ABC transporter, ATP-binding protein  36.22 
 
 
270 aa  118  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.755313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2406  ABC transporter, ATP-binding protein  36.22 
 
 
255 aa  118  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  41.4 
 
 
229 aa  118  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  36.11 
 
 
408 aa  118  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1297  ABC transporter related  41.15 
 
 
652 aa  118  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2892  ABC transporter, ATP-binding protein  37.11 
 
 
251 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1663  ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 
219 aa  118  9e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.557172 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  36.22 
 
 
230 aa  118  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  40.84 
 
 
224 aa  118  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  37 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  36.13 
 
 
228 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  38.39 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  39.53 
 
 
644 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4857  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2355  ABC transporter, ATP-binding protein  36.22 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2972  ABC transporter, ATP-binding protein  36.22 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.344281 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4659  ABC transporter related  34.16 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5204  bacitracin export ATP-binding protein BceA  34.9 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  40.32 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2196  ABC transporter related  36.22 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111069  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  34.88 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  42.86 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1387  ABC transporter related protein  35.94 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0529  ABC transport protein  34.43 
 
 
220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.476252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2310  ABC transporter related  35.68 
 
 
253 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00369124  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  42.93 
 
 
225 aa  116  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  39.63 
 
 
237 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  39.06 
 
 
234 aa  116  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  36.13 
 
 
226 aa  116  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3112  ABC transporter related  43.01 
 
 
225 aa  116  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  39.63 
 
 
237 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  37.96 
 
 
652 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  37.76 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  34.42 
 
 
232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  42.78 
 
 
243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4881  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
253 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  40.35 
 
 
222 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  31.94 
 
 
231 aa  115  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2023  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
253 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  38.46 
 
 
249 aa  115  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.48 
 
 
238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>