74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2269 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  100 
 
 		 271 aa  531  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  48.29 
 
 		 267 aa  253  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11200  membrane-like protein  57.79 
 
 		 273 aa  201  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00435487  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  35.91 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  37.62 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  35.76 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  35.55 
 
 		 332 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  31.54 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  35.32 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  38.53 
 
 		 318 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  40.2 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  37.32 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  34.04 
 
 		 300 aa  92  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  33.49 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  31.76 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  27.27 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4758  hypothetical protein  30 
 
 		 196 aa  72  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343516  normal  0.0425976 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2311  hypothetical protein  37.67 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.57 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3846  hypothetical protein  31.96 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.04 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2068  membrane protein-like protein  30.37 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5833  hypothetical protein  30.13 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0159  hypothetical protein  30.11 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  26.58 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3120  hypothetical protein  30.53 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136448 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2794  hypothetical protein  31.77 
 
 		 195 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  23.93 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2401  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  23.88 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.14 
 
 		 290 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3987  hypothetical protein  20.16 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4150  hypothetical protein  21.34 
 
 		 301 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3852  hypothetical protein  21.34 
 
 		 301 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3955  hypothetical protein  21.34 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  24.32 
 
 		 679 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3700  CtaG membrane protein  21.34 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3683  hypothetical protein  21.34 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4042  hypothetical protein  20.28 
 
 		 301 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.388035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1197  hypothetical protein  20.3 
 
 		 319 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  26.12 
 
 		 394 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4058  hypothetical protein  19.76 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3384  hypothetical protein  33.07 
 
 		 266 aa  52.8  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.739679 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  28.45 
 
 		 664 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0455  hypothetical protein  24.37 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1859  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  20 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  23.71 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0855  hypothetical protein  32.82 
 
 		 214 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  23.6 
 
 		 327 aa  50.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  26.29 
 
 		 671 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2514  hypothetical protein  32.82 
 
 		 214 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  23.28 
 
 		 289 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  24.14 
 
 		 266 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2642  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  20.15 
 
 		 301 aa  48.9  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  24.66 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  26.37 
 
 		 671 aa  48.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  28.64 
 
 		 692 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  25.93 
 
 		 651 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3766  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  19.55 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.71 
 
 		 654 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  23.22 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  25.38 
 
 		 687 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  22.8 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  25.1 
 
 		 322 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  24.77 
 
 		 678 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  27.41 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  27.41 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3889  hypothetical protein  30.08 
 
 		 239 aa  42  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31119  normal  0.156158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>