84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2248 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  63.79 
 
 		 313 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  63.12 
 
 		 313 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  56.91 
 
 		 316 aa  341  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  56 
 
 		 309 aa  330  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  55.56 
 
 		 312 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  47.88 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  47.27 
 
 		 332 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  47.56 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  47.02 
 
 		 335 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  47.52 
 
 		 331 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  47.85 
 
 		 325 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  47.85 
 
 		 325 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  47.19 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  47.68 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  47.21 
 
 		 320 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  46.69 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  46.69 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  47.21 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  46.36 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  44.7 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  44.98 
 
 		 323 aa  242  6e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  44.16 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  43.18 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  47.42 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  47.42 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  44.41 
 
 		 323 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  46.59 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  46.46 
 
 		 273 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  32.9 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  31.83 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  31.97 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  37.12 
 
 		 287 aa  92.4  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  37.88 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  40.16 
 
 		 141 aa  85.9  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  36.11 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  38.89 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  38.62 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  31.65 
 
 		 146 aa  80.9  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  35.43 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  34.09 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  41.38 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  35.21 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.3 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  37.24 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  30.8 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  38.57 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  32.58 
 
 		 205 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  32.33 
 
 		 140 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  32.58 
 
 		 205 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  32.58 
 
 		 205 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  32.58 
 
 		 205 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  32.58 
 
 		 205 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  30.3 
 
 		 152 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  32.58 
 
 		 142 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  32.58 
 
 		 142 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  37.41 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  37.41 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  28.79 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  35.34 
 
 		 144 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  31.58 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  31.58 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  32.58 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  31.58 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  30.29 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  32.33 
 
 		 156 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  31.58 
 
 		 182 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  29.93 
 
 		 152 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  33.08 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  33.79 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  29.2 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  31.67 
 
 		 128 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  28.57 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0965  ChrB domain-containing protein  30.52 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1175  ChrB domain protein  29.8 
 
 		 172 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105237  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4139  ChrB domain-containing protein  27.92 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5227  chromate resistance signal  55.88 
 
 		 53 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266795  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0285  ChrB domain protein  28.06 
 
 		 187 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1926  ChrB domain-containing protein  26.28 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>