94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2193 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_2193  ICC-like putative phosphoesterase  100 
 
 
226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0751085  hitchhiker  0.00311079 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1204  metallophosphoesterase  68.25 
 
 
218 aa  291  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3881  hypothetical protein  65.89 
 
 
218 aa  279  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65628  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4142  hypothetical protein  64.81 
 
 
218 aa  271  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1102  hypothetical protein  60.87 
 
 
216 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1142  ICC-like protein putative phosphoesterase  61.35 
 
 
216 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.221625  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1131  metallophosphoesterase  58.14 
 
 
219 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595514  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4310  ICC-like putative phosphoesterase  60.66 
 
 
216 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601938  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1852  hypothetical protein  57.75 
 
 
231 aa  239  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407761  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4856  metallophosphoesterase  58.29 
 
 
227 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3046  metallophosphoesterase  56.42 
 
 
239 aa  230  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0160441  normal  0.430681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0377  metallophosphoesterase  53.39 
 
 
258 aa  224  9e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3549  ICC-like putative phosphoesterase  48.62 
 
 
241 aa  215  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1516  hypothetical protein  54.5 
 
 
214 aa  204  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0308  metallophosphoesterase  53.49 
 
 
224 aa  202  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0944102  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0313  metallophosphoesterase  53.02 
 
 
224 aa  199  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1339  metallophosphoesterase  52.45 
 
 
238 aa  195  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0355  metallophosphoesterase  45.75 
 
 
227 aa  186  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4459  metallophosphoesterase  46.63 
 
 
219 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238847  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0777  putative phosphoesterase  47.67 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0261984  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6752  metallophosphoesterase  42.66 
 
 
222 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2962  metallophosphoesterase  40.65 
 
 
213 aa  138  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000570828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2564  ICC-like putative phosphoesterase  35.98 
 
 
211 aa  138  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01734  Ser/Thr protein phosphatase family protein  41.59 
 
 
214 aa  138  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6865  metallophosphoesterase  35.82 
 
 
215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.999179  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3526  ICC-like phosphoesterase  34.3 
 
 
214 aa  129  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3331  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
213 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1757  metallophosphoesterase  29.25 
 
 
210 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02260  hypothetical protein  34.92 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4041  hypothetical protein  35.07 
 
 
238 aa  105  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0774  hypothetical protein  34.12 
 
 
238 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000158093  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0825  hypothetical protein  33.65 
 
 
238 aa  101  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.0000998399  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0454  putative ICC-like phosphoesterase  37.17 
 
 
238 aa  95.9  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2051  metallophosphoesterase  34.87 
 
 
235 aa  95.5  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.150021  normal  0.706568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3548  ICC-like protein putative phosphoesterase  35.98 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.330272 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0241  metallophosphoesterase  31.22 
 
 
231 aa  92.4  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45585  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0264  hypothetical protein  32.43 
 
 
239 aa  92  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0409149 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08611  Serine/threonine specific protein phosphatase  26.87 
 
 
214 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.550698  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07811  Serine/threonine specific protein phosphatase  30.81 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.815111  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1453  hypothetical protein  36.95 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0437211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0798  metallophosphoesterase  32.47 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235454  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4250  putative ICC-like phosphoesterase  33.33 
 
 
237 aa  89  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887431  normal  0.946064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2537  ICC-like phosphoesterases-like  34.55 
 
 
224 aa  88.2  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3479  putative ICC-like phosphoesterase  33.17 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3155  putative ICC-like phosphoesterase  32.67 
 
 
237 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3028  metallophosphoesterase  34.2 
 
 
238 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4612  hypothetical protein  32.84 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0186  metallophosphoesterase  31.09 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0998122  normal  0.609449 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0731  serine/threonine specific protein phosphatase  29.73 
 
 
216 aa  85.9  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.148819  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07811  Serine/threonine specific protein phosphatase  28.65 
 
 
216 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0531  metallophosphoesterase  30.28 
 
 
235 aa  85.5  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0803  hypothetical protein  30.41 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4759  putative ICC-like phosphoesterase  31.63 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110473  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0028  metallophosphoesterase  34.01 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3351  putative ICC-like phosphoesterase  33.66 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264147  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0746  hypothetical protein  29.65 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.895245  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0538  metallophosphoesterase  32.17 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28806  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0616  hypothetical protein  28.57 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877239  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0876  metallophosphoesterase  31.68 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432456  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3146  metallophosphoesterase  29.38 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0259204  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00671  metallophosphoesterase  28.14 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0597826  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0767  hypothetical protein  32.79 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0233  metallophosphoesterase  30.48 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1889  hypothetical protein  31.02 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0573  ICC-like putative phosphoesterase  31.63 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0659  putative metallo-phosphoesterase  31.96 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2312  metallophosphoesterase  31.96 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.198359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0203  putative phosphoesterase protein  34.44 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201439  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0985  hypothetical protein  29.15 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.280922  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1118  hypothetical protein  28.06 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0373  hypothetical protein  31.48 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0464  metallophosphoesterase  26.78 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0118793  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0414  putative metallo-phosphoesterase  30.94 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1614  ICC-like protein putative phosphoesterase  34.24 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1928  phosphoesterase  25.27 
 
 
251 aa  63.5  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1310  metallophosphoesterase  29.74 
 
 
235 aa  62  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2796  metallophosphoesterase  27.47 
 
 
228 aa  61.6  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0443  metallophosphoesterase  29.36 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0393  metallophosphoesterase  29.46 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1526  metallophosphoesterase  29.41 
 
 
236 aa  58.5  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.0019874  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0152  metallophosphoesterase  29.19 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.114454 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2823  hypothetical protein  28.57 
 
 
225 aa  52.8  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.117431  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1509  phosphoesterase, putative  27.53 
 
 
238 aa  52.8  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0181928  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0415  phosphoesterase  25.48 
 
 
234 aa  52  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2571  metallophosphoesterase  27.45 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423141  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0316  phosphoesterase  20.56 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0546  metallophosphoesterase  27 
 
 
251 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0574725  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3084  metallophosphoesterase  36.96 
 
 
319 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0926  phosphoesterase, putative  26.78 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0534  phosphoesterase, putative  22.78 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.988231  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5194  metallophosphoesterase  36.26 
 
 
293 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0595  metallophosphoesterase  25.61 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.417936  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2517  metallophosphoesterase  28.86 
 
 
424 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1212  metallophosphoesterase  26.39 
 
 
493 aa  42  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0151714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>