18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1973 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1973  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  270  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.182667  normal  0.0517042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2453  hypothetical protein  67.72 
 
 		 132 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0386558  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28140  hypothetical protein  70.08 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00031566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2156  hypothetical protein  54.14 
 
 		 133 aa  141  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0270  hypothetical protein  39.68 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.57996e-16  n/a   
 
 
 
NC_011901  Tgr7_0296  hypothetical protein  40.94 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0908189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0295  hypothetical protein  38.46 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0254657  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1111  hypothetical protein  43.36 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.247105  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03119  hypothetical protein  33.93 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4195  hypothetical protein  34.17 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1287  hypothetical protein  37.86 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000342569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0531  hypothetical protein  33.08 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.721524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1042  hypothetical protein  37.8 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2525  hypothetical protein  27.36 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197599  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0088  hypothetical protein  39.22 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1836  hypothetical protein  31.19 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118115  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1827  hypothetical protein  36.99 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1105  hypothetical protein  27.16 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0816974 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>