More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1862 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1862  adenylylsulfate kinase  100 
 
 
208 aa  434  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310492  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1687  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  71.82 
 
 
638 aa  286  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2888  adenylylsulfate kinase  59.26 
 
 
198 aa  240  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  59.04 
 
 
614 aa  238  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  59.68 
 
 
604 aa  234  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0866  adenylylsulfate kinase  57.14 
 
 
205 aa  234  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0903  adenylylsulfate kinase  57.14 
 
 
205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3184  adenylylsulfate kinase  58.2 
 
 
207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3723  adenylylsulfate kinase  57.14 
 
 
205 aa  232  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3069  adenylylsulfate kinase  56.61 
 
 
205 aa  232  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2145  adenylylsulfate kinase  56.08 
 
 
209 aa  231  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2622  adenylylsulfate kinase  58.73 
 
 
199 aa  230  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0591419  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0962  adenylylsulfate kinase  57.45 
 
 
205 aa  230  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0483  adenylylsulfate kinase  61.24 
 
 
203 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389945  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1068  sulfate adenylyltransferase, large subunit  58.33 
 
 
652 aa  228  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0423  adenylylsulfate kinase  56.48 
 
 
210 aa  226  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0666  adenylylsulfate kinase  54.5 
 
 
205 aa  226  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1650  adenylylsulfate kinase  56.32 
 
 
198 aa  224  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3040  adenylylsulfate kinase  56.15 
 
 
205 aa  224  8e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1526  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  55.85 
 
 
633 aa  224  8e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465942 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2100  adenylylsulfate kinase  55.79 
 
 
214 aa  223  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02714  adenylylsulfate kinase  57.89 
 
 
198 aa  223  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29899  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3519  adenylate sulfate kinase protein  61.99 
 
 
209 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0957  adenylylsulfate kinase  55.61 
 
 
205 aa  222  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1500  adenylylsulfate kinase  55.91 
 
 
198 aa  222  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2345  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  52.24 
 
 
638 aa  222  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0931  adenylylsulfate kinase  55.61 
 
 
205 aa  222  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01831  adenylylsulfate kinase  55.61 
 
 
217 aa  221  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.573546  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3405  adenylylsulfate kinase  55.08 
 
 
205 aa  221  7e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0965  adenylylsulfate kinase  55.61 
 
 
205 aa  221  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2135  adenylylsulfate kinase  52.76 
 
 
215 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27091  adenylylsulfate kinase  53.57 
 
 
227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0070  sulfate adenylyltransferase, large subunit  56.35 
 
 
652 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.972692  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1532  sulfate adenylyltransferase, large subunit  55.08 
 
 
647 aa  218  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2420  adenylylsulfate kinase  52.79 
 
 
214 aa  218  5e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02135  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  56.15 
 
 
598 aa  218  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0800  adenylyl-sulfate kinase  52.24 
 
 
210 aa  218  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000729878 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1291  adenylylsulfate kinase  54.4 
 
 
203 aa  218  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00500  Adenylylsulfate kinase, C-terminal domain protein  62.2 
 
 
198 aa  217  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.413176  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16180  Adenylylsulfate kinase  59.65 
 
 
197 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.732852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4087  adenylylsulfate kinase  53.4 
 
 
212 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0411  adenylylsulfate kinase  51.81 
 
 
201 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3342  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  59.88 
 
 
640 aa  216  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.914743  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  55.32 
 
 
644 aa  216  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01841  adenylylsulfate kinase  54.01 
 
 
207 aa  214  5e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3345  Adenylyl-sulfate kinase  53.51 
 
 
203 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0939  adenylylsulfate kinase  53.68 
 
 
208 aa  214  5.9999999999999996e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67173  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1689  adenylyl-sulfate kinase  50.99 
 
 
222 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664653  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2185  adenylylsulfate kinase  51.34 
 
 
199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2350  adenylyl-sulfate kinase  52.33 
 
 
199 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.745  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6392  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  55.85 
 
 
640 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2290  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  53.16 
 
 
641 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2136  adenylylsulfate kinase  53.06 
 
 
199 aa  211  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00619163  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0168  adenylylsulfate kinase  49.25 
 
 
211 aa  211  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2957  adenylyl-sulfate kinase  48.79 
 
 
228 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3831  adenylyl-sulfate kinase  53.8 
 
 
208 aa  211  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000161314  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001704  adenylylsulfate kinase  54.21 
 
 
205 aa  211  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1530  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  53.48 
 
 
651 aa  210  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861038  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5496  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  55.32 
 
 
640 aa  210  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2985  adenylyl-sulfate kinase  48.77 
 
 
223 aa  210  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.879711  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01861  adenylylsulfate kinase  52.94 
 
 
207 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  54.5 
 
 
638 aa  209  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1398  sulfate adenylyltransferase, large subunit  55.98 
 
 
639 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0369421  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0967  adenylylsulfate kinase  49.51 
 
 
213 aa  209  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6191  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  55.56 
 
 
633 aa  208  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1749  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  58.79 
 
 
642 aa  208  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3434  adenylylsulfate kinase  49.51 
 
 
234 aa  208  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.658603  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02401  adenylylsulfate kinase  56.02 
 
 
212 aa  208  5e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0186  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  57.89 
 
 
644 aa  208  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0471725  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0194  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  57.89 
 
 
644 aa  208  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0986259  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24694  adenylylsulfate kinase  55.29 
 
 
201 aa  207  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00769  adenylylsulfate kinase  55 
 
 
205 aa  207  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0299  adenylylsulfate kinase  52.17 
 
 
225 aa  207  8e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2204  adenylylsulfate kinase  52.94 
 
 
203 aa  207  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1425  adenylyl-sulfate kinase  49.76 
 
 
209 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.403059  normal  0.0845056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4225  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  58.68 
 
 
647 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3516  adenylylsulfate kinase  50.98 
 
 
205 aa  206  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3302  adenylylsulfate kinase  49.03 
 
 
213 aa  206  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3359  adenylylsulfate kinase  53.16 
 
 
205 aa  206  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4560  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  53.97 
 
 
633 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0201  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  56.18 
 
 
644 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.987097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0834  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  54.75 
 
 
640 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2338  adenylyl-sulfate kinase  52.6 
 
 
227 aa  206  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00543558  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0712  adenylyl-sulfate kinase  52.41 
 
 
201 aa  206  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000090997  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4396  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  51.32 
 
 
640 aa  204  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0637  adenylylsulfate kinase  54.55 
 
 
211 aa  204  7e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0833  adenylylsulfate kinase  52.88 
 
 
204 aa  204  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1533  adenylylsulfate kinase  54.82 
 
 
212 aa  204  8e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0864  adenylylsulfate kinase  50.78 
 
 
207 aa  204  8e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1780  sulfate adenylyltransferase, large subunit  50.56 
 
 
647 aa  202  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1584  adenylylsulfate kinase  50.27 
 
 
197 aa  201  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2482  adenylylsulfate kinase  50.79 
 
 
212 aa  201  8e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.288285  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1319  sulfate adenylyltransferase, large subunit  60 
 
 
621 aa  201  9e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.692528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1546  adenylylsulfate kinase  50.27 
 
 
197 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1305  adenylylsulfate kinase  50.27 
 
 
197 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1306  adenylylsulfate kinase  50.27 
 
 
197 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2576  adenylylsulfate kinase  56.14 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2450  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  51.35 
 
 
631 aa  200  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1478  adenylylsulfate kinase  49.73 
 
 
197 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3243  adenylylsulfate kinase  51.56 
 
 
201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>