More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1851 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 369 aa  735    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  83.06 
 
 		 369 aa  587  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  81.3 
 
 		 370 aa  580  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  81.69 
 
 		 369 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  79.89 
 
 		 370 aa  566  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  65.04 
 
 		 374 aa  478  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  60.53 
 
 		 373 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  58.7 
 
 		 370 aa  428  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  62.15 
 
 		 365 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  58.73 
 
 		 369 aa  412  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  62.87 
 
 		 384 aa  408  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  55.62 
 
 		 392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  58.22 
 
 		 374 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  59.54 
 
 		 374 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  52.62 
 
 		 369 aa  402  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  57.26 
 
 		 385 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  59.32 
 
 		 374 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  55.77 
 
 		 370 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  57.49 
 
 		 371 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  56.67 
 
 		 370 aa  391  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  59.05 
 
 		 376 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  56.82 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  58.18 
 
 		 379 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  52.7 
 
 		 373 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  56.27 
 
 		 370 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  54.57 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  56.27 
 
 		 374 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  55.77 
 
 		 362 aa  358  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  52.62 
 
 		 374 aa  349  4e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  55.11 
 
 		 394 aa  348  7e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  53.17 
 
 		 374 aa  348  8e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  52.59 
 
 		 365 aa  335  5e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  52.59 
 
 		 365 aa  335  5e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  48.03 
 
 		 362 aa  332  8e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  46.32 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  49.59 
 
 		 380 aa  318  7e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  48.92 
 
 		 380 aa  318  7e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  48.02 
 
 		 386 aa  318  7.999999999999999e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  48.62 
 
 		 363 aa  314  9.999999999999999e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  43.6 
 
 		 370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  43.1 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  43.54 
 
 		 388 aa  300  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  42.42 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  46.96 
 
 		 365 aa  296  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  45.9 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  45.98 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  42.82 
 
 		 374 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 		 373 aa  286  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  43.89 
 
 		 363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4299  aminotransferase  48.59 
 
 		 373 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  40.23 
 
 		 370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  42.08 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 		 370 aa  278  8e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  40.23 
 
 		 370 aa  278  8e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 		 370 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 		 370 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  41.8 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 		 370 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  42.78 
 
 		 365 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  39.66 
 
 		 370 aa  276  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  45.53 
 
 		 383 aa  276  5e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  45.17 
 
 		 365 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  39.38 
 
 		 370 aa  267  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  37.88 
 
 		 389 aa  259  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  40.66 
 
 		 372 aa  258  9e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  40.92 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1874  histidinol-phosphate aminotransferase  41.21 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  39.66 
 
 		 378 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  40.88 
 
 		 372 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  38.84 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  35.99 
 
 		 377 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  37.47 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  36.54 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 		 365 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  45.02 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 		 370 aa  249  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  37.12 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  39.23 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  38.67 
 
 		 369 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9607  histidinol-phosphate aminotransferase  40.17 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  38 
 
 		 366 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0394  histidinol-phosphate aminotransferase  40.5 
 
 		 392 aa  246  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  37.74 
 
 		 366 aa  245  6.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  38.57 
 
 		 366 aa  245  9e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  36.26 
 
 		 365 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  38.07 
 
 		 366 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  39.45 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  34.92 
 
 		 375 aa  243  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  40.88 
 
 		 373 aa  242  6e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  37.71 
 
 		 366 aa  242  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  38.97 
 
 		 351 aa  242  9e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  41.89 
 
 		 377 aa  242  9e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5817  histidinol-phosphate aminotransferase  40.21 
 
 		 370 aa  242  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4034  histidinol-phosphate aminotransferase  38.67 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  38.19 
 
 		 383 aa  240  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3264  histidinol-phosphate aminotransferase  39.41 
 
 		 368 aa  239  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0217  histidinol-phosphate aminotransferase  37.92 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  38.35 
 
 		 365 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>