More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1802 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  73.46 
 
 
451 aa  654    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  75.62 
 
 
453 aa  669    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  100 
 
 
452 aa  908    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  61.16 
 
 
455 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  60.18 
 
 
458 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  58.76 
 
 
453 aa  552  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  61.31 
 
 
453 aa  548  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  63.02 
 
 
458 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  62.79 
 
 
458 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  62.56 
 
 
458 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  51.01 
 
 
474 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  51.24 
 
 
474 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  48.96 
 
 
443 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  47 
 
 
440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  48.1 
 
 
378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  47.87 
 
 
378 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  46.42 
 
 
442 aa  398  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  45.58 
 
 
466 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  47.95 
 
 
447 aa  393  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  47.34 
 
 
433 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  45.7 
 
 
460 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  46.65 
 
 
461 aa  391  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  47.15 
 
 
448 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  46.12 
 
 
471 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  48.72 
 
 
468 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  44.95 
 
 
488 aa  384  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  43.55 
 
 
487 aa  380  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  45.17 
 
 
446 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  45.35 
 
 
430 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  43.93 
 
 
460 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  46.88 
 
 
439 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  42.16 
 
 
460 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  44.62 
 
 
471 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  50.63 
 
 
475 aa  376  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  40.6 
 
 
463 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  46.37 
 
 
471 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.6 
 
 
460 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.93 
 
 
473 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  43.27 
 
 
460 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  43.27 
 
 
460 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  43.71 
 
 
460 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  42.89 
 
 
481 aa  365  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  43.27 
 
 
460 aa  365  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.83 
 
 
460 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.83 
 
 
460 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.83 
 
 
460 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  42.83 
 
 
460 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  42.83 
 
 
484 aa  358  7e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  43.05 
 
 
460 aa  358  9e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  41.76 
 
 
463 aa  358  9e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  44.85 
 
 
472 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  42.05 
 
 
444 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  40.49 
 
 
460 aa  347  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  41.33 
 
 
486 aa  346  4e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  43.85 
 
 
472 aa  346  5e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  40.84 
 
 
460 aa  343  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  43.36 
 
 
474 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  38.98 
 
 
455 aa  324  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  43.4 
 
 
480 aa  320  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  44.16 
 
 
430 aa  316  5e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  41.85 
 
 
674 aa  308  9e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.23 
 
 
468 aa  297  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.03 
 
 
399 aa  283  6.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  39.51 
 
 
395 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.62 
 
 
389 aa  280  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.91 
 
 
416 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  39.13 
 
 
471 aa  279  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  39.13 
 
 
469 aa  279  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.9 
 
 
389 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  40.39 
 
 
395 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  39.02 
 
 
395 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.19 
 
 
396 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  40.19 
 
 
396 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.19 
 
 
396 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.19 
 
 
396 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.95 
 
 
396 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.34 
 
 
410 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.66 
 
 
421 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  38.86 
 
 
391 aa  269  7e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.56 
 
 
394 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.05 
 
 
394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.31 
 
 
394 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.12 
 
 
424 aa  259  6e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.7 
 
 
399 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.05 
 
 
394 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37 
 
 
518 aa  256  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4206  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.5 
 
 
437 aa  249  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.66 
 
 
468 aa  249  5e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.32 
 
 
427 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.37 
 
 
439 aa  245  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.59 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.44 
 
 
390 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.01612  normal  0.250186 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.23 
 
 
428 aa  230  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05073  putative hemolysin-type secretion transmembrane protein  39.95 
 
 
358 aa  227  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  38.46 
 
 
439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.35 
 
 
389 aa  216  5e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  32.61 
 
 
389 aa  212  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0730  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.71 
 
 
455 aa  210  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.187305  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2078  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.09 
 
 
458 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.732091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0787  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.78 
 
 
403 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>