More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1769 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 284 aa  564  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  72.18 
 
 		 284 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  74.3 
 
 		 284 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  73.59 
 
 		 284 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  72.18 
 
 		 284 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  69.72 
 
 		 284 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  69.01 
 
 		 284 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  68.31 
 
 		 284 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  68.31 
 
 		 284 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  66.08 
 
 		 284 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  66.08 
 
 		 285 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  50.53 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  51.43 
 
 		 289 aa  262  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  50.36 
 
 		 289 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.3 
 
 		 285 aa  258  7e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  51.74 
 
 		 296 aa  258  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  49.11 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  50.53 
 
 		 278 aa  249  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  48.96 
 
 		 295 aa  248  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  48.57 
 
 		 289 aa  248  9e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  50.35 
 
 		 284 aa  247  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  48.93 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  48.93 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.93 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  48.93 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  48.93 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  48.93 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.93 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  48.61 
 
 		 295 aa  244  8e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  44.56 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.25 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50 
 
 		 292 aa  236  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  48.93 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  47.52 
 
 		 279 aa  234  8e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  47.52 
 
 		 283 aa  234  9e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  49.47 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.77 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  48.06 
 
 		 285 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  50.89 
 
 		 291 aa  232  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.79 
 
 		 289 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.74 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  50.7 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  41.49 
 
 		 278 aa  225  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.75 
 
 		 289 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  42.4 
 
 		 288 aa  222  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.75 
 
 		 289 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  48.75 
 
 		 289 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  47.14 
 
 		 289 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  46.64 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.39 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  45.49 
 
 		 304 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  48.4 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2010  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.67 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0121868  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.64 
 
 		 280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.6 
 
 		 292 aa  215  5e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  47.48 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.5 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2880  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.79 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518579  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  47.45 
 
 		 275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1776  Rhodanese domain protein  49.08 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  38.99 
 
 		 277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  47.73 
 
 		 280 aa  212  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1566  Rhodanese domain protein  41.89 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  38.99 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0764  Rhodanese domain protein  40.14 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  50.19 
 
 		 627 aa  210  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  40.21 
 
 		 291 aa  208  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  39.21 
 
 		 277 aa  208  9e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  37.32 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  38.27 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0951  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.33 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  45.31 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  38.63 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  38.63 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  38.63 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  38.63 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.33 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1033  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.33 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0667917 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3278  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.9 
 
 		 330 aa  205  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  45.32 
 
 		 288 aa  204  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3485  rhodanese domain-containing protein  41.28 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  39.63 
 
 		 272 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  45.94 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  37.91 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  47.51 
 
 		 287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0556  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.81 
 
 		 276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  46.93 
 
 		 687 aa  198  7.999999999999999e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  37.77 
 
 		 277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1846  Rhodanese domain protein  40.07 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  40.07 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.99 
 
 		 276 aa  196  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 272 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  40.73 
 
 		 276 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.95 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  43.66 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1095  Rhodanese domain protein  36.43 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  46.53 
 
 		 282 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1426  Rhodanese domain protein  40.71 
 
 		 276 aa  192  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.630889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  41.43 
 
 		 289 aa  189  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>