More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1746 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  60.1 
 
 		 212 aa  258  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  60.1 
 
 		 214 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  59.05 
 
 		 214 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  59.52 
 
 		 214 aa  255  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  61.69 
 
 		 226 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  55.77 
 
 		 242 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  57.71 
 
 		 205 aa  238  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  54.11 
 
 		 242 aa  228  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  58.46 
 
 		 205 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  57.84 
 
 		 193 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  43.85 
 
 		 173 aa  154  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  41.11 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  43.45 
 
 		 177 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  51.59 
 
 		 177 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  46.72 
 
 		 181 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  50.79 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  49.6 
 
 		 178 aa  138  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  52.38 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  52.38 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  35.71 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  45.65 
 
 		 177 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  41.76 
 
 		 174 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 179 aa  129  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  45.93 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  39.59 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  39.67 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  39.67 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  39.67 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  39.67 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  39.67 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  39.67 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  39.67 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  39.67 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  43.79 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  44.37 
 
 		 208 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  38.38 
 
 		 194 aa  121  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  38.38 
 
 		 194 aa  121  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  43.66 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  37.24 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  46.72 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  38.1 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  38.98 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  42.76 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  48.39 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  44.06 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  45.9 
 
 		 223 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  45.9 
 
 		 223 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  45.9 
 
 		 223 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  45.08 
 
 		 223 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  45.08 
 
 		 223 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  43.14 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  38.65 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  45.08 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  38.92 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  39.88 
 
 		 191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  46.96 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  37.04 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  37.84 
 
 		 190 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  37.84 
 
 		 190 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  37.84 
 
 		 190 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  46.09 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  46.09 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  46.09 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  32.8 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  46.09 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  46.09 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  46.09 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  46.09 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  46.09 
 
 		 221 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  36.7 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  48.36 
 
 		 255 aa  111  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3984  NLP/P60 protein  38.33 
 
 		 173 aa  111  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 216 aa  111  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  42.19 
 
 		 319 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  45.08 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  41.98 
 
 		 169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  42.24 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  42.24 
 
 		 271 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  46.72 
 
 		 150 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  42.24 
 
 		 271 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  42.24 
 
 		 271 aa  109  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  42.38 
 
 		 147 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  48.28 
 
 		 170 aa  109  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  42.24 
 
 		 271 aa  109  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  48.25 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  42.24 
 
 		 271 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  42.24 
 
 		 271 aa  109  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  42.38 
 
 		 147 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  42.24 
 
 		 271 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  42.19 
 
 		 133 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  42.24 
 
 		 271 aa  109  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  41.88 
 
 		 273 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  47.37 
 
 		 228 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  42.19 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  41.88 
 
 		 273 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>