More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1744 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1744  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  100 
 
 
179 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2129  molybdopterin biosynthetic protein B2  89.94 
 
 
179 aa  332  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24900  molybdopterin biosynthetic protein B2  89.39 
 
 
179 aa  331  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2122  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  87.71 
 
 
179 aa  323  9e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1663  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  87.15 
 
 
179 aa  322  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.474566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3619  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  87.15 
 
 
179 aa  321  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3961  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  87.15 
 
 
179 aa  319  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1639  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  86.59 
 
 
179 aa  318  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14120  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  83.8 
 
 
185 aa  312  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2352  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  82.68 
 
 
179 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2136  molybdenum cofactor biosynthesis protein  81.56 
 
 
179 aa  300  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386786  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2150  molybdopterin biosynthetic protein B2  80.45 
 
 
179 aa  298  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3908  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  77.65 
 
 
179 aa  297  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4129  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  79.33 
 
 
179 aa  296  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1289  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  79.33 
 
 
179 aa  296  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4600  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  79.65 
 
 
172 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13260  MoaB1  67.93 
 
 
185 aa  250  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.205864  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1193  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  67.39 
 
 
185 aa  247  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0789398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2158  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  64.09 
 
 
181 aa  247  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0821287  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3525  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  65.29 
 
 
178 aa  238  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1314  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  65.66 
 
 
180 aa  234  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186786  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0711  molybdopterin binding domain-containing protein  66.87 
 
 
176 aa  234  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4635  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  59.78 
 
 
180 aa  234  6e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4792  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  63.58 
 
 
174 aa  234  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000262709  hitchhiker  0.000000182116 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01047  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  68.1 
 
 
168 aa  233  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.3558  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0612  molybdenum cofactor biosynthesis protein  64.46 
 
 
176 aa  228  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0218  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  64.63 
 
 
175 aa  229  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0088  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  60.8 
 
 
176 aa  227  9e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151206  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4401  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  59.77 
 
 
174 aa  226  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109195  hitchhiker  0.00152144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2358  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  65.22 
 
 
169 aa  225  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.668196  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0545  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  61.54 
 
 
170 aa  224  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2170  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  59.17 
 
 
171 aa  223  9e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.932861  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002955  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  60.36 
 
 
170 aa  223  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1321  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  60 
 
 
170 aa  222  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.389564  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02953  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  60.36 
 
 
170 aa  222  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4119  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  58.14 
 
 
174 aa  220  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2156  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  61.76 
 
 
172 aa  216  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.934291  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2951  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  58.68 
 
 
172 aa  216  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.552166  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0480  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  61.08 
 
 
190 aa  215  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.606146  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1513  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  57.65 
 
 
172 aa  214  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1919  molybdopterin binding protein  65.27 
 
 
174 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.954333  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1138  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  60.23 
 
 
179 aa  207  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.728668  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0866  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  58.68 
 
 
170 aa  207  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.43182  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0929  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  58.68 
 
 
170 aa  207  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.757758  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0838  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  58.68 
 
 
170 aa  207  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0897  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  58.68 
 
 
170 aa  207  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0952  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  58.68 
 
 
170 aa  207  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03860  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  57.22 
 
 
181 aa  206  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2689  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  65.43 
 
 
171 aa  205  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158705  normal  0.178292 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04550  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  61.96 
 
 
172 aa  204  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2860  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  59.26 
 
 
170 aa  204  7e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.554552  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2861  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  59.26 
 
 
170 aa  204  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32721  normal  0.0116866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0805  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  59.26 
 
 
170 aa  204  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000677242  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2570  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  59.26 
 
 
170 aa  204  7e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000231482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0930  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  59.26 
 
 
170 aa  204  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0836  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  59.26 
 
 
170 aa  204  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.439171  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0845  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  58.64 
 
 
170 aa  203  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.245412  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2434  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  56.29 
 
 
170 aa  203  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2525  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  55.09 
 
 
170 aa  202  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0268  molybdopterin binding domain-containing protein  59.63 
 
 
182 aa  201  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1246  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  58.24 
 
 
185 aa  200  9e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00749  molybdopterin biosynthesis protein B  58.64 
 
 
170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00766  hypothetical protein  58.64 
 
 
170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1274  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  55.09 
 
 
170 aa  195  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0565702  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2805  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  58.28 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.777834  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1778  molybdopterin binding domain-containing protein  55.7 
 
 
175 aa  187  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.21967  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0713  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  54.6 
 
 
179 aa  187  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3855  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  55.56 
 
 
189 aa  184  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2011  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  60.76 
 
 
173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159714  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2281  molybdopterin binding domain-containing protein  58.44 
 
 
177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1075  molybdopterin binding protein  61.39 
 
 
182 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1754  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  62.03 
 
 
178 aa  181  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2334  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  62.03 
 
 
186 aa  181  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3064  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  55.06 
 
 
180 aa  180  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.591367  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1202  molybdenum cofactor biosynthesis protein  60.13 
 
 
183 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6457  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  56.52 
 
 
212 aa  179  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.664659  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0940  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  59.49 
 
 
182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6073  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  61.39 
 
 
181 aa  178  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2601  molybdopterin biosynthesis protein B  60.13 
 
 
187 aa  178  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1220  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  58.86 
 
 
182 aa  178  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3223  molybdopterin binding domain-containing protein  60.13 
 
 
187 aa  177  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2653  molybdopterin binding domain-containing protein  57.14 
 
 
165 aa  176  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0958  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  58.86 
 
 
185 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5418  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  60.76 
 
 
181 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2821  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  52.87 
 
 
180 aa  174  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.689591 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3217  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  52.87 
 
 
180 aa  174  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3678  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  60.13 
 
 
185 aa  174  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.555886  normal  0.427303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0995  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  57.59 
 
 
206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0936  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  57.59 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4097  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  56.63 
 
 
175 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203087  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0059  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  53.99 
 
 
184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0728283  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1911  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  59.64 
 
 
172 aa  171  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0520  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  56.96 
 
 
183 aa  167  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696711  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0705  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  55.06 
 
 
180 aa  167  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104213  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0455  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  56.33 
 
 
180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.445831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0564  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  55.06 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266076  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3089  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  54.66 
 
 
180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242629  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2714  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  43.98 
 
 
171 aa  160  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.393929 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3900  molybdopterin binding domain-containing protein  55.7 
 
 
180 aa  156  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1182  molybdenum cofactor biosynthesis protein  56.41 
 
 
174 aa  155  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131676  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>