22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1606 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1606  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.0962013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3860  hypothetical protein  68.09 
 
 		 193 aa  250  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2172  hypothetical protein  67.55 
 
 		 199 aa  244  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25420  hypothetical protein  67.55 
 
 		 254 aa  244  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1670  type IV pilus assembly PilZ  64.77 
 
 		 194 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1694  type IV pilus assembly PilZ  64.2 
 
 		 194 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3589  type IV pilus assembly PilZ  63.07 
 
 		 194 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.549929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2153  type IV pilus assembly PilZ  63.07 
 
 		 194 aa  223  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2108  hypothetical protein  58.51 
 
 		 195 aa  222  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1903  hypothetical protein  58.52 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378219  hitchhiker  0.00133315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1808  hypothetical protein  31.49 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1748  hypothetical protein  35.36 
 
 		 219 aa  89.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.690123  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1890  hypothetical protein  27.03 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1901  hypothetical protein  27.03 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3217  modification methylase HemK  24.87 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1844  type IV pilus assembly PilZ  24.06 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.177632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1726  hypothetical protein  27.12 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2288  hypothetical protein  25.62 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02436  hypothetical protein  24.58 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1731  hypothetical protein  25 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000442595  normal  0.728518 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2256  hypothetical protein  24.07 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1811  hypothetical protein  22.98 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0129545  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>