66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1417 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  100 
 
 		 165 aa  340  4e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50940  hypothetical protein  73.33 
 
 		 164 aa  253  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30636  hitchhiker  0.0000172849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4345  hypothetical protein  71.05 
 
 		 151 aa  231  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19360  hypothetical protein  67.91 
 
 		 136 aa  193  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.865107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1217  hypothetical protein  50.91 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4130  hypothetical protein  47.85 
 
 		 164 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25340  hypothetical protein  48.48 
 
 		 167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3866  hypothetical protein  44.79 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1139  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  47.89 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4298  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  46.48 
 
 		 158 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.541122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1115  putative lipoprotein  45.77 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1154  water stress/hypersensitive response protein  45.07 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3789  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0609  hypothetical protein  34.07 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1587  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  33.63 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  29.93 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1708  hypothetical protein  36.13 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1928  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  28.08 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198508  normal  0.554929 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3583  hypothetical protein  31.45 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1574  trigger factor  29.66 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0399  hypothetical protein  30.88 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2902  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  29.2 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586012  normal  0.820452 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1033  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  27.78 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2944  hypothetical protein  31.9 
 
 		 198 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3726  hypothetical protein  30 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0494  hypothetical protein  31.19 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2611  hypothetical protein  31.19 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3163  putative lipoprotein  30.65 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2815  hypothetical protein  30.65 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0426  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  29.84 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.63413 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0927  Late embryogenesis abundant protein 2  26.15 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5672e-31 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3621  putative lipoprotein  30.65 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3634  putative lipoprotein  30.65 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3609  putative lipoprotein  30.65 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1729  putative lipoprotein  30.65 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0037  putative lipoprotein  30.65 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01550  putative lipoprotein  29.37 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814803  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3319  Late embryogenesis abundant protein 2  26.45 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000162689  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3440  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  28.99 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0467  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  30.28 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1086  water stress/hypersensitive response protein  28.45 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0203  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2421  hypothetical protein  28 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2272  putative lipoprotein  28.26 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000762605  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0098  Late embryogenesis abundant protein 2  27.27 
 
 		 277 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0086  Late embryogenesis abundant protein 2  27.27 
 
 		 277 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2191  putative lipoprotein  26.57 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0080  hypothetical protein  27.27 
 
 		 295 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.669106  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  28.87 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3165  lipoprotein, putative  28.07 
 
 		 159 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3546  water stress/hypersensitive response protein  25.87 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2572  putative lipoprotein  25.44 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  26.28 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  26.28 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1815  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  24.66 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0854923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0086  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  25 
 
 		 166 aa  48.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0413  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  34.83 
 
 		 280 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0384  hypothetical protein  34.88 
 
 		 277 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3032  putative lipoprotein  27.19 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0397077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1164  water stress/hypersensitive response protein  25.26 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0079  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  27.59 
 
 		 276 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.801419  normal  0.160349 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0226  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0412  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  36.05 
 
 		 280 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1043  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  26.42 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.402135 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2756  water stress/hypersensitive response protein  21.48 
 
 		 264 aa  41.2  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3555  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  25 
 
 		 160 aa  40.4  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.113514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>