More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1358 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  38.7 
 
 		 1241 aa  832    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  53.09 
 
 		 1205 aa  1282    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  74.21 
 
 		 1200 aa  1830    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  50.64 
 
 		 1207 aa  1208    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  58 
 
 		 1200 aa  1397    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  53.34 
 
 		 677 aa  716    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  53.61 
 
 		 1179 aa  1279    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  79.8 
 
 		 1226 aa  2002    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  51.17 
 
 		 1204 aa  1214    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  58.31 
 
 		 1197 aa  1364    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  58.39 
 
 		 1203 aa  1390    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  57.2 
 
 		 1205 aa  1356    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  54.85 
 
 		 1228 aa  1297    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  82.63 
 
 		 1488 aa  1291    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  57.15 
 
 		 1201 aa  1368    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  55.75 
 
 		 1238 aa  1291    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  58.45 
 
 		 1233 aa  1377    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  53.37 
 
 		 1172 aa  1266    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  81.14 
 
 		 1210 aa  2019    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  56.29 
 
 		 1203 aa  1341    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  59.39 
 
 		 1204 aa  1442    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  52.87 
 
 		 1206 aa  1305    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  53.66 
 
 		 1179 aa  1214    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  53.46 
 
 		 1162 aa  745    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  56.32 
 
 		 1212 aa  1422    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  74.53 
 
 		 1201 aa  1821    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  51.89 
 
 		 1204 aa  1256    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  100 
 
 		 1231 aa  2505    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  53.77 
 
 		 1197 aa  1284    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  53.35 
 
 		 1179 aa  1276    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  52.55 
 
 		 1180 aa  1222    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  53.17 
 
 		 1176 aa  1240    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  56.84 
 
 		 1209 aa  1405    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  50.12 
 
 		 1220 aa  1132    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  52.22 
 
 		 1183 aa  1258    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  56.3 
 
 		 1205 aa  1308    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  52.27 
 
 		 1183 aa  1245    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  50.14 
 
 		 663 aa  653    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  52.09 
 
 		 1209 aa  1241    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  55.92 
 
 		 1208 aa  1370    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  51.49 
 
 		 1204 aa  1232    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  74.23 
 
 		 1203 aa  1828    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  52.07 
 
 		 1182 aa  1261    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  52.35 
 
 		 1243 aa  1290    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  56.5 
 
 		 1205 aa  1347    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  52.64 
 
 		 1205 aa  1159    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  49.88 
 
 		 1208 aa  1191    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  50.36 
 
 		 1201 aa  1168    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  53.63 
 
 		 1204 aa  1149    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  53.09 
 
 		 1176 aa  1241    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  52.64 
 
 		 1205 aa  1160    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  56.06 
 
 		 1209 aa  1354    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  52.64 
 
 		 1205 aa  1159    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  42.08 
 
 		 1822 aa  1030    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  53.18 
 
 		 1234 aa  1197    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  56.5 
 
 		 1205 aa  1347    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  50.08 
 
 		 1212 aa  1038    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2426  pyruvate carboxylase subunit A  46.43 
 
 		 498 aa  414  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1598  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.46 
 
 		 446 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000269909  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1544  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  46.62 
 
 		 447 aa  405  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  hitchhiker  0.00898283 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2807  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.1 
 
 		 652 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.167198  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1333  pyruvate carboxylase subunit A  45.31 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1660  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.66 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000380  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  46.38 
 
 		 686 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1016  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.22 
 
 		 446 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000161184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.84 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6137  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.55 
 
 		 667 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768375  normal  0.18157 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00691  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.19 
 
 		 449 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2022  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.18 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0711095  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2028  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.4 
 
 		 446 aa  398  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.256761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0516  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.09 
 
 		 447 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0701369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1342  pyruvate carboxylase subunit A  44.87 
 
 		 494 aa  398  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.492096  normal  0.0929613 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4238  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  42.04 
 
 		 670 aa  399  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00721  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.85 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.249054  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1869  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.36 
 
 		 676 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2263  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  49.1 
 
 		 661 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5683  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  48.65 
 
 		 666 aa  395  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1792  hypothetical protein  46.21 
 
 		 654 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1793  hypothetical protein  46.43 
 
 		 654 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0865  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.98 
 
 		 666 aa  396  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2191  propionyl-CoA carboxylase alpha subunit  48.98 
 
 		 695 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01241  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.17 
 
 		 447 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.114391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0062  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.07 
 
 		 448 aa  397  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4148  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.01 
 
 		 448 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.34 
 
 		 670 aa  397  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26670  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  48.87 
 
 		 661 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00711  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.62 
 
 		 449 aa  396  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2019  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.47 
 
 		 446 aa  392  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274625  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0385  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  40 
 
 		 671 aa  392  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1423  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.17 
 
 		 447 aa  393  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0984  biotin carboxylase / acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  44.25 
 
 		 446 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000016105  normal  0.0128167 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0051  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  44.12 
 
 		 448 aa  390  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2302  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.53 
 
 		 666 aa  393  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5245  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.69 
 
 		 447 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0611  pyruvate carboxylase subunit A  45.09 
 
 		 497 aa  391  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.937558  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0466  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.74 
 
 		 445 aa  390  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0174688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0521  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.78 
 
 		 448 aa  392  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0922671  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2002  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.97 
 
 		 667 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1039  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.19 
 
 		 447 aa  388  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1587  pyruvate carboxylase subunit A  43.53 
 
 		 493 aa  389  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>