68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1351 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 		 217 aa  431  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8729  putative DsbA-like thioredoxin protein  60.66 
 
 		 221 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  51.67 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  52.63 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  52.63 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  52.63 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  52.63 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  52.63 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  52.66 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  52.63 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  43.12 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  39.91 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  30.57 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  29.56 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  33.16 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  31.19 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  32 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  27.96 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  39.52 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  28.3 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  28.3 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  28.3 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  26.19 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  27.18 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  27.35 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  28.24 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  28.24 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  29 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  38.21 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  26.76 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  34.31 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  29.22 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  31.43 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  31.91 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  40 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  35.04 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  27.27 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  30.33 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  30.81 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  31.94 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  28.31 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  30.48 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  28.87 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  28.37 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  24.2 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  30.33 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  28.48 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  26.26 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  34.07 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  29.82 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  28.41 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  25.93 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  23.74 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  29.31 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  27.41 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  30.05 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  37.21 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  29.71 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  23.35 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  28.35 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  29.5 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  30.61 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  27.52 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  28.03 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>