More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1199 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
546 aa  1069  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  58.25 
 
 
595 aa  559  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  57.41 
 
 
551 aa  550  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  54.48 
 
 
558 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  53.16 
 
 
575 aa  494  1e-138  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  50.64 
 
 
561 aa  489  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  49.64 
 
 
562 aa  488  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  50.27 
 
 
566 aa  482  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  48.71 
 
 
541 aa  472  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  51.74 
 
 
561 aa  471  1e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  50.64 
 
 
572 aa  465  1e-130  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  48.72 
 
 
572 aa  459  1e-128  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  46.21 
 
 
548 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  49.16 
 
 
720 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  45.76 
 
 
547 aa  407  1e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  45.76 
 
 
547 aa  408  1e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  47.62 
 
 
566 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  58.12 
 
 
424 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  36.88 
 
 
566 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  37.4 
 
 
566 aa  372  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  1.10445e-08 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  37.04 
 
 
565 aa  363  3e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  36.5 
 
 
566 aa  351  2e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  31.89 
 
 
576 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  30.31 
 
 
577 aa  223  8e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2433  sodium/hydrogen exchanger  31.26 
 
 
578 aa  221  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 
571 aa  218  3e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.59 
 
 
575 aa  216  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  30.36 
 
 
574 aa  214  2e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  30.11 
 
 
592 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  32.06 
 
 
574 aa  211  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  28.65 
 
 
650 aa  196  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  26.52 
 
 
648 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  26.52 
 
 
648 aa  191  3e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  28.83 
 
 
667 aa  190  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  26.52 
 
 
648 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  30.56 
 
 
581 aa  186  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  26.77 
 
 
567 aa  186  9e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.07 
 
 
567 aa  186  1e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  27.73 
 
 
567 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  26.33 
 
 
648 aa  184  4e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 
673 aa  183  8e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  28.62 
 
 
775 aa  180  6e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  7.97462e-07 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  28.83 
 
 
670 aa  180  6e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  2.5266e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4125  sodium/hydrogen exchanger  27.4 
 
 
584 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.688995  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  25.33 
 
 
648 aa  176  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  29.6 
 
 
671 aa  176  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  28.01 
 
 
660 aa  176  1e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  29.6 
 
 
598 aa  175  2e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  24.76 
 
 
648 aa  175  2e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  24.76 
 
 
648 aa  175  2e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  4.90638e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  25.76 
 
 
648 aa  174  4e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  25.05 
 
 
648 aa  174  4e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  26.06 
 
 
649 aa  174  4e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  28.28 
 
 
674 aa  173  7e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.14 
 
 
720 aa  173  7e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  26 
 
 
649 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  27.9 
 
 
773 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  26.05 
 
 
662 aa  172  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  27.59 
 
 
771 aa  171  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  27.49 
 
 
682 aa  171  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  29.13 
 
 
674 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  27.55 
 
 
660 aa  168  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  28.04 
 
 
762 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  24.77 
 
 
666 aa  168  3e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  29.08 
 
 
662 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  28.31 
 
 
665 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  28.31 
 
 
665 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.37 
 
 
659 aa  166  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 
674 aa  166  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  28.3 
 
 
658 aa  166  1e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  28.62 
 
 
652 aa  166  1e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.91 
 
 
588 aa  166  1e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  28.62 
 
 
583 aa  166  1e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  28.39 
 
 
665 aa  166  1e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  27.46 
 
 
562 aa  165  2e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  1.31586e-05 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  28.97 
 
 
664 aa  165  2e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  27.48 
 
 
658 aa  165  2e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  3.81991e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  27.79 
 
 
563 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 
565 aa  164  4e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 
693 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  27.47 
 
 
567 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  27.6 
 
 
563 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  26.9 
 
 
654 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  29.11 
 
 
659 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0188  sodium/hydrogen exchanger  27.52 
 
 
624 aa  160  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 
656 aa  160  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  29.37 
 
 
668 aa  160  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  28.31 
 
 
664 aa  159  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  29.11 
 
 
659 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 
661 aa  159  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  28.19 
 
 
741 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1189  sodium/hydrogen exchanger  29.42 
 
 
534 aa  159  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.49 
 
 
671 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.54 
 
 
680 aa  158  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  27.09 
 
 
561 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  27.01 
 
 
684 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  24.62 
 
 
650 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2033  sodium/hydrogen exchanger  28.31 
 
 
565 aa  157  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  28.51 
 
 
562 aa  157  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  29.27 
 
 
666 aa  156  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>