More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1175 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 416 aa  825    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  55.88 
 
 		 415 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  52.49 
 
 		 408 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  50.37 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  50.37 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  50.37 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  51.16 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  52.35 
 
 		 408 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  55.3 
 
 		 417 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  54.4 
 
 		 464 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  54.4 
 
 		 425 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  49.36 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  48.41 
 
 		 428 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  42.12 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  41.01 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  44.09 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  41.16 
 
 		 426 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  39.58 
 
 		 418 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  39.32 
 
 		 418 aa  247  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  37.24 
 
 		 421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  38.86 
 
 		 443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  39.83 
 
 		 443 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  39.83 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  39.83 
 
 		 461 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  39.83 
 
 		 443 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  39.83 
 
 		 461 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  39.83 
 
 		 461 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  39.83 
 
 		 461 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  36.69 
 
 		 440 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  40.11 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  37.27 
 
 		 443 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  39.55 
 
 		 442 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  37.06 
 
 		 433 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  36.15 
 
 		 458 aa  216  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  36.22 
 
 		 435 aa  212  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  36.16 
 
 		 439 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  36.16 
 
 		 439 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  36.24 
 
 		 437 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  38.66 
 
 		 444 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  36.7 
 
 		 471 aa  202  9e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  33.96 
 
 		 472 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  38.29 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  37.18 
 
 		 441 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  33.75 
 
 		 423 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  31.91 
 
 		 423 aa  155  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  31.28 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  30.18 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  31.42 
 
 		 423 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  32.28 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  30.35 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  32.12 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  29.79 
 
 		 422 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  30.95 
 
 		 425 aa  143  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  30.61 
 
 		 438 aa  143  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  28.79 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  30.38 
 
 		 433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.78 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  29.72 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  30.42 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  26.94 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  26.34 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  30.58 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  28.37 
 
 		 432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  26.84 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  29.05 
 
 		 407 aa  113  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  27.51 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  29.37 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  27.82 
 
 		 437 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  27.18 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  27.74 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  27.23 
 
 		 436 aa  107  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  25.89 
 
 		 479 aa  106  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  27.71 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1111  Outer membrane efflux protein  31.08 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.33067  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2148  outer membrane efflux protein  33.16 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  26.12 
 
 		 437 aa  103  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  23.73 
 
 		 416 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  27.9 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  27.69 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.01 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  28.46 
 
 		 433 aa  100  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 453 aa  99.8  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.07 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  24.31 
 
 		 448 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31040  putative cation efflux system protein  26.15 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000919684  unclonable  5.14474e-22 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  23.66 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  27.41 
 
 		 485 aa  93.6  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  24.61 
 
 		 446 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  29.3 
 
 		 435 aa  89.7  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  27.83 
 
 		 413 aa  89.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  23.87 
 
 		 473 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6208  outer membrane efflux protein  29.33 
 
 		 418 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1957  putative RND efflux system protein  25.42 
 
 		 444 aa  87  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2321  outer membrane efflux protein  29.15 
 
 		 428 aa  87.4  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760032  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  27.3 
 
 		 451 aa  86.7  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  27.74 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  29.63 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3455  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414344  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3607  outer membrane efflux protein  30.25 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.864513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>