142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1106 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1106  carbamate kinase  100 
 
 		 308 aa  623  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0757388  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5913  carbamate kinase  82.26 
 
 		 310 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68350  carbamate kinase  81.61 
 
 		 310 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.221419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4388  carbamate kinase  79.94 
 
 		 309 aa  511  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692138  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0998  carbamate kinase  78.64 
 
 		 309 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0999  carbamate kinase  78.32 
 
 		 309 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.782851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1036  carbamate kinase  78.32 
 
 		 309 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873124  normal  0.536796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4225  carbamate kinase  78.32 
 
 		 309 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.375863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2686  carbamate kinase  77.02 
 
 		 309 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6441  carbamate kinase  77.27 
 
 		 312 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841619  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1147  carbamate kinase  75.4 
 
 		 312 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.506597  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2126  carbamate kinase  75.4 
 
 		 312 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.118318  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1587  carbamate kinase  75.4 
 
 		 313 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0246  carbamate kinase  75.4 
 
 		 313 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264579  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1966  carbamate kinase  75.4 
 
 		 313 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1984  carbamate kinase  75.4 
 
 		 313 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193138  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0913  carbamate kinase  75.4 
 
 		 313 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2386  carbamate kinase  74.76 
 
 		 312 aa  478  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0668132  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4539  carbamate kinase  71.84 
 
 		 312 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10506  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1389  carbamate kinase  65.57 
 
 		 314 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373109  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2426  carbamate kinase  64.92 
 
 		 318 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2177  carbamate kinase  61.79 
 
 		 304 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5204  carbamate kinase  63.02 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1875  carbamate kinase  62.58 
 
 		 303 aa  358  8e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0748  carbamate kinase  58.82 
 
 		 312 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3187  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  55.02 
 
 		 308 aa  333  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2239  carbamate kinase  60.54 
 
 		 305 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126564  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4648  carbamate kinase  56.95 
 
 		 302 aa  329  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2359  carbamate kinase  53.31 
 
 		 301 aa  320  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2409  carbamate kinase  53.31 
 
 		 301 aa  320  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4813  carbamate kinase  52.48 
 
 		 310 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.42996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4868  carbamate kinase  52.48 
 
 		 310 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4720  carbamate kinase  52.48 
 
 		 310 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4750  carbamate kinase  52.48 
 
 		 310 aa  315  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4849  carbamate kinase  52.48 
 
 		 310 aa  315  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5577  carbamate kinase  61.13 
 
 		 302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0451  carbamate kinase  53.72 
 
 		 303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0361431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1145  carbamate kinase  54.52 
 
 		 300 aa  311  6.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.986133  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00471  predicted carbamate kinase  55.37 
 
 		 297 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00476  hypothetical protein  55.37 
 
 		 297 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0595  carbamate kinase  55.37 
 
 		 297 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00468071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3101  carbamate kinase  55.37 
 
 		 297 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0566  carbamate kinase  55.7 
 
 		 297 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.16633  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3092  carbamate kinase  55.03 
 
 		 297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0312776  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0559  carbamate kinase  54.7 
 
 		 297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0136389  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0622  carbamate kinase  55.03 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0578  carbamate kinase  53.69 
 
 		 297 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0250065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0585  carbamate kinase  53.36 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.130187 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0640  carbamate kinase  53.36 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0580  carbamate kinase  53.36 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2963  carbamate kinase  55 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3874  carbamate kinase  53.64 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2798  Carbamate kinase  50.33 
 
 		 311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0583  carbamate kinase  55 
 
 		 310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0434  carbamate kinase  56.58 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.741665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1784  Carbamate kinase  52.17 
 
 		 301 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00351606  normal  0.0183756 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0172  carbamate kinase  47.18 
 
 		 307 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1620  carbamate kinase  50.82 
 
 		 298 aa  252  6e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1927  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  45.07 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0219816  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1788  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  46.38 
 
 		 311 aa  249  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0485  carbamate kinase  48.39 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000618454  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0247  carbamate kinase  46.6 
 
 		 314 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0069  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  44.77 
 
 		 313 aa  244  9e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0164  carbamate kinase  45.19 
 
 		 314 aa  235  9e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1820  carbamate kinase  43.69 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0047  carbamate kinase  43.32 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0160  carbamate kinase  44.87 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0039  carbamate kinase  47.23 
 
 		 309 aa  231  8.000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1948  carbamate kinase  44.63 
 
 		 314 aa  231  9e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.572312  hitchhiker  0.000272947 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2487  carbamate kinase  44.59 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2786  carbamate kinase  44.59 
 
 		 314 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0529  carbamate kinase  45.25 
 
 		 298 aa  230  3e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2650  carbamate kinase  45.19 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2117  carbamate kinase  44.48 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.43365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0183  carbamate kinase  46.33 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0269  carbamate kinase  45.4 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000010285  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2319  carbamate kinase  42.44 
 
 		 314 aa  219  5e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0242  carbamate kinase  44.79 
 
 		 313 aa  218  7.999999999999999e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000109106  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2125  carbamate kinase  44.19 
 
 		 308 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4895  carbamate kinase  43.23 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.428226  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0475  carbamate kinase  42.9 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0423  carbamate kinase  42.9 
 
 		 320 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2167  carbamate kinase  41.94 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0344  carbamate kinase  42.58 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0410  carbamate kinase  42.58 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00340879 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0351  carbamate kinase  42.32 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2318  carbamate kinase  43.73 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2476  carbamate kinase  45.34 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2352  carbamate kinase  39.74 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0659  carbamate kinase  45.25 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_24238  carbamate kinase  41.93 
 
 		 336 aa  208  8e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1429  carbamate kinase  43.73 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1228  carbamate kinase  40.26 
 
 		 311 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1253  carbamate kinase  40.26 
 
 		 311 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.661641  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06560  carbamate kinase  42.59 
 
 		 319 aa  202  4e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.298804 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0426  carbamate kinase  41.61 
 
 		 310 aa  202  5e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0645  carbamate kinase  40.79 
 
 		 298 aa  201  9e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.101685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2656  carbamate kinase  39.94 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.168651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2712  carbamate kinase  39.94 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1838  carbamate kinase  40.91 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.955077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>