48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1099 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1099  cyanophycinase  100 
 
 		 418 aa  841    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.517521  normal  0.0298062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2878  cyanophycinase-related exopeptidase  30.39 
 
 		 458 aa  121  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  30.71 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  32.56 
 
 		 280 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2394  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  32.09 
 
 		 559 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1095  cyanophycinase-like protein  32.05 
 
 		 587 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.092083  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  27.24 
 
 		 269 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2050  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  28.29 
 
 		 541 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338236  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2002  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  29.16 
 
 		 541 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.083735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  29.41 
 
 		 273 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1987  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  27.89 
 
 		 541 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2337  Cyanophycinase and related exopeptidase-like protein  28.61 
 
 		 598 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.704877  normal  0.140679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  32.55 
 
 		 289 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  25.61 
 
 		 273 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  31.52 
 
 		 278 aa  92  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  25.94 
 
 		 284 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  31.56 
 
 		 274 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  26.26 
 
 		 274 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  31.78 
 
 		 328 aa  89  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  30.03 
 
 		 287 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  31.89 
 
 		 287 aa  87  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  30.03 
 
 		 287 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1351  cyanophycinase  29.23 
 
 		 269 aa  86.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  30.66 
 
 		 297 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  27.52 
 
 		 269 aa  86.7  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  27.39 
 
 		 284 aa  86.7  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  27.3 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  27.84 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  28.82 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  28.35 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  28.8 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2919  cyanophycinase  24.92 
 
 		 474 aa  80.5  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  26.39 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  29.43 
 
 		 611 aa  77.8  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  28.17 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  29.32 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2731  cyanophycinase  27.17 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1121  peptidase S51 dipeptidase E  36.02 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  hitchhiker  0.00178513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1621  peptidase S51 dipeptidase E  28.17 
 
 		 317 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4153  cyanophycinase  27.05 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  24.89 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  23.94 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  25.5 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  31.65 
 
 		 339 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4208  cyanophycinase-like protein  30.3 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0515  Cyanophycinase-like exopeptidase  25.53 
 
 		 323 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  23.32 
 
 		 348 aa  46.6  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  24.89 
 
 		 323 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>