54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1095 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1095  cyanophycinase-like protein  100 
 
 
587 aa  1186    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.092083  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2919  cyanophycinase  30.13 
 
 
474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2878  cyanophycinase-related exopeptidase  30 
 
 
458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  31.02 
 
 
269 aa  100  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  28.67 
 
 
289 aa  97.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  30.83 
 
 
274 aa  92.8  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  34.6 
 
 
327 aa  92.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2731  cyanophycinase  27.86 
 
 
295 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  30.45 
 
 
297 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  27.97 
 
 
291 aa  88.2  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1621  peptidase S51 dipeptidase E  29.87 
 
 
317 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  29.72 
 
 
280 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  30.28 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  28.43 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1099  cyanophycinase  30.62 
 
 
418 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.517521  normal  0.0298062 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1351  cyanophycinase  28.97 
 
 
269 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  27.1 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  31.38 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  29.89 
 
 
611 aa  76.6  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  28.91 
 
 
281 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  28.9 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  26.36 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  28.17 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  29.43 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  29.43 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  28.14 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  27.38 
 
 
273 aa  73.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2394  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  26.64 
 
 
559 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.746369 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0515  Cyanophycinase-like exopeptidase  26.47 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  28.64 
 
 
278 aa  65.1  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  28.16 
 
 
275 aa  63.5  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  25.97 
 
 
294 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  29.55 
 
 
284 aa  62.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  30.95 
 
 
328 aa  61.2  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  24.5 
 
 
278 aa  60.8  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4153  cyanophycinase  25.45 
 
 
289 aa  57  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  26.52 
 
 
348 aa  54.7  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  23.53 
 
 
279 aa  53.9  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  27.23 
 
 
323 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  30 
 
 
339 aa  52  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  24.77 
 
 
346 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2283  cyanophycinase and related exopeptidase-like  27.46 
 
 
331 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  30 
 
 
1174 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03370  S-layer domain protein  31.73 
 
 
396 aa  50.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  25.09 
 
 
291 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  22.67 
 
 
575 aa  48.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0089  S-layer domain protein  22.11 
 
 
807 aa  48.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025043 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.52 
 
 
1328 aa  46.6  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4531  S-layer region-like  29.07 
 
 
231 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1023  S-layer protein  34.07 
 
 
218 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2050  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  26.63 
 
 
541 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338236  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1121  peptidase S51 dipeptidase E  27.93 
 
 
340 aa  43.9  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  hitchhiker  0.00178513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1987  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  26.29 
 
 
541 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  22.45 
 
 
629 aa  44.3  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>