More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1059 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  85.92 
 
 		 425 aa  741    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  84.73 
 
 		 425 aa  724    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  84.96 
 
 		 425 aa  727    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  86.43 
 
 		 428 aa  734    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  85.92 
 
 		 425 aa  740    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  86.62 
 
 		 425 aa  748    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  86.85 
 
 		 425 aa  755    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 426 aa  858    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  87.89 
 
 		 422 aa  755    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  87.89 
 
 		 422 aa  755    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  82.18 
 
 		 408 aa  670    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  63.46 
 
 		 429 aa  529  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  59.52 
 
 		 425 aa  486  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  57.45 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  55.98 
 
 		 422 aa  471  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  57.82 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  53.01 
 
 		 423 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  54.52 
 
 		 421 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  59.06 
 
 		 439 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  53.24 
 
 		 419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  53.72 
 
 		 420 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  51.55 
 
 		 422 aa  440  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  54.5 
 
 		 446 aa  440  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  54.44 
 
 		 416 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  56.53 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  53.22 
 
 		 416 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  53.1 
 
 		 416 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0919  glutamyl-tRNA reductase  54.2 
 
 		 416 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  53.1 
 
 		 416 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0722  glutamyl-tRNA reductase  51.91 
 
 		 416 aa  428  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.131936  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  53.1 
 
 		 416 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  51.56 
 
 		 419 aa  430  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  51.08 
 
 		 418 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  50.84 
 
 		 418 aa  431  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  52.86 
 
 		 416 aa  427  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  50.6 
 
 		 418 aa  428  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  52.15 
 
 		 416 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  51.32 
 
 		 416 aa  425  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  52.14 
 
 		 416 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3686  glutamyl-tRNA reductase  50.96 
 
 		 416 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  0.509552 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  51.79 
 
 		 416 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  52.14 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  52.38 
 
 		 416 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  50.24 
 
 		 426 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2065  glutamyl-tRNA reductase  49.16 
 
 		 431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0118  glutamyl-tRNA reductase  49.16 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000526977  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  49.88 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  47.34 
 
 		 434 aa  398  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  50.12 
 
 		 418 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  50.12 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  49.4 
 
 		 449 aa  396  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  50.12 
 
 		 418 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  49.88 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  49.88 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  49.88 
 
 		 418 aa  393  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  49.88 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2461  glutamyl-tRNA reductase  50.6 
 
 		 420 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000933086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2067  glutamyl-tRNA reductase  50.6 
 
 		 420 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.85694e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  49.88 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  52.49 
 
 		 414 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  49.88 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  49.88 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  49.4 
 
 		 420 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  49.88 
 
 		 416 aa  391  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  49.64 
 
 		 418 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  49.88 
 
 		 418 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  49.88 
 
 		 418 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  49.16 
 
 		 418 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  49.88 
 
 		 418 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  49.88 
 
 		 418 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2180  glutamyl-tRNA reductase  50.6 
 
 		 438 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00403267  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  49.4 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  48.33 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  48.1 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  48.1 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  48.1 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  48.57 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  48.1 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  48.33 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  47.86 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  48.1 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  48.1 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  47.47 
 
 		 416 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  48.57 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  48.1 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  48.1 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  47.87 
 
 		 432 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  47.87 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  48.66 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  47.86 
 
 		 432 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0581  glutamyl-tRNA reductase  47.27 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  49.14 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1855  glutamyl-tRNA reductase  48.56 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163682  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  48.1 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  47.87 
 
 		 432 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4205  glutamyl-tRNA reductase  48.6 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  45.17 
 
 		 424 aa  362  9e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0810  glutamyl-tRNA reductase  44.34 
 
 		 459 aa  361  1e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  44.93 
 
 		 424 aa  359  7e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3145  glutamyl-tRNA reductase  47.54 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0225946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>