34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1051 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1051  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  386  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5553  hypothetical protein  46.33 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1248  hypothetical protein  46.89 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0560994  decreased coverage  0.00000150811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2708  hypothetical protein  42.46 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.463816  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2752  hypothetical protein  42.46 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2738  hypothetical protein  42.46 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526378  normal  0.0730468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1978  hypothetical protein  34.32 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.628499  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2648  beta-lactamase domain protein  30.49 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4155  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2624  beta-lactamase domain protein  34.15 
 
 		 290 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4330  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0646  Beta-lactamase-like  30.08 
 
 		 298 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4601  hypothetical protein  27.56 
 
 		 289 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2145  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 289 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.518031  normal  0.715051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2101  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 289 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3174  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 		 290 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3439  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 228 aa  48.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  44.68 
 
 		 324 aa  47.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2615  hypothetical protein  41.43 
 
 		 106 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1736  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2813  beta-lactamase-like protein  30.71 
 
 		 226 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1268  beta-lactamase domain protein  38.16 
 
 		 288 aa  44.7  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3287  hypothetical protein  30.71 
 
 		 226 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0422328  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.46 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  30.19 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14831  Zn-dependent hydrolase  26.72 
 
 		 304 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.861965  normal  0.085675 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0088  hypothetical protein  30.16 
 
 		 240 aa  43.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.45541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  32.99 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 		 327 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  25.32 
 
 		 253 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 		 327 aa  41.6  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0560  beta-lactamase domain-containing protein  42.25 
 
 		 267 aa  41.2  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  25.31 
 
 		 204 aa  41.2  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  29.01 
 
 		 213 aa  41.2  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>