More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1007 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1007  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  100 
 
 
163 aa  323  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  hitchhiker  0.00000000512539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4679  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  96.93 
 
 
163 aa  318  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0755  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  96.93 
 
 
163 aa  318  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100684  hitchhiker  0.000000273125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4677  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  96.93 
 
 
163 aa  318  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  hitchhiker  0.00000000335837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  96.93 
 
 
163 aa  318  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0246688  hitchhiker  0.000231458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0982  acetolactate synthase, small subunit  95.71 
 
 
163 aa  316  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  95.71 
 
 
163 aa  316  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5409  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  96.32 
 
 
163 aa  315  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62150  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  96.32 
 
 
163 aa  315  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0299879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4787  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  94.48 
 
 
163 aa  314  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0258419  hitchhiker  0.00663707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42510  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  92.02 
 
 
163 aa  306  6.999999999999999e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0883  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  81.6 
 
 
163 aa  273  6e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0737902  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  80.37 
 
 
163 aa  269  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000667629  hitchhiker  0.0000555489 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1320  acetolactate synthase, small subunit  75.46 
 
 
163 aa  259  8e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  76.69 
 
 
163 aa  257  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0122567  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.1 
 
 
163 aa  241  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113705  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0397  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.1 
 
 
163 aa  241  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458686  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1420  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.1 
 
 
163 aa  241  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.1 
 
 
163 aa  241  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0752  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.1 
 
 
163 aa  241  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1046  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.1 
 
 
163 aa  241  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1275  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.1 
 
 
163 aa  241  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1114  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.1 
 
 
163 aa  241  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2287  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.87 
 
 
163 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.766326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3230  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.87 
 
 
163 aa  239  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88024  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1653  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.87 
 
 
163 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1014  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.87 
 
 
163 aa  239  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2302  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.87 
 
 
163 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353704  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2264  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.87 
 
 
163 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2180  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.87 
 
 
163 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177341  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5591  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.87 
 
 
163 aa  239  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1329  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.26 
 
 
163 aa  237  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  70.55 
 
 
163 aa  237  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0912  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.1 
 
 
163 aa  236  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2076  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  67.48 
 
 
163 aa  235  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  67.48 
 
 
163 aa  235  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2021  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.64 
 
 
163 aa  235  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2227  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  67.48 
 
 
163 aa  235  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.469114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0948  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.1 
 
 
163 aa  234  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1990  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  67.9 
 
 
165 aa  231  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  67.48 
 
 
163 aa  231  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3792  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  67.28 
 
 
163 aa  228  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3604  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  67.28 
 
 
163 aa  228  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2318  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.8 
 
 
163 aa  227  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342254  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1718  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.42 
 
 
163 aa  227  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0129853  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2271  acetolactate synthase, small subunit  66.87 
 
 
163 aa  227  6e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  68.9 
 
 
164 aa  227  6e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2104  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.42 
 
 
163 aa  226  7e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2892  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.42 
 
 
163 aa  226  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.018126 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3111  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.42 
 
 
163 aa  226  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00654911  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.42 
 
 
163 aa  225  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1775  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.67 
 
 
164 aa  224  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1627  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.25 
 
 
164 aa  224  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.800745  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1746  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.42 
 
 
163 aa  224  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0694  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.41 
 
 
164 aa  224  4e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1952  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.8 
 
 
163 aa  224  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3323  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.42 
 
 
163 aa  224  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0749  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.05 
 
 
163 aa  224  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1770  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.8 
 
 
163 aa  224  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488316  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2157  acetolactate synthase, small subunit  65.03 
 
 
163 aa  223  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001648  acetolactate synthase small subunit  67.28 
 
 
164 aa  224  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00890505  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0528  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.81 
 
 
165 aa  223  7e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.973022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0635  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.67 
 
 
163 aa  223  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33731  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0072  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.05 
 
 
163 aa  223  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0080  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.05 
 
 
163 aa  223  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0087  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.05 
 
 
173 aa  222  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0084  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.05 
 
 
163 aa  223  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00826  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  67.28 
 
 
164 aa  223  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  67.28 
 
 
164 aa  222  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2369  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.58 
 
 
163 aa  221  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.41 
 
 
164 aa  222  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4866  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.19 
 
 
163 aa  221  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0610  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.43 
 
 
164 aa  221  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.948647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0133  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.81 
 
 
164 aa  221  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0084  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.43 
 
 
173 aa  221  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0128  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.81 
 
 
164 aa  221  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.480792  hitchhiker  0.000114859 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0523  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.58 
 
 
165 aa  221  4e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.612451  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0126  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.81 
 
 
164 aa  221  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0133  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.81 
 
 
169 aa  221  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0129  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.81 
 
 
164 aa  221  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.942992  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0625  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.81 
 
 
163 aa  221  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22823 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00080  acetolactate synthase small subunit  65.43 
 
 
163 aa  220  8e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3521  acetolactate synthase, small subunit  65.43 
 
 
163 aa  220  8e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00079  hypothetical protein  65.43 
 
 
163 aa  220  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3579  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.43 
 
 
163 aa  220  8e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000722238 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0597  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.2 
 
 
163 aa  219  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.539091  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2705  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.85 
 
 
164 aa  219  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3074  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.1 
 
 
163 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617205 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1062  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  69.39 
 
 
163 aa  218  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0811  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  69.39 
 
 
163 aa  218  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2123  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.75 
 
 
164 aa  217  7e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.343992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2139  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.2 
 
 
164 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  62.11 
 
 
163 aa  215  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  62.11 
 
 
161 aa  215  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1972  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.81 
 
 
164 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0607984  hitchhiker  0.0000404141 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2491  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.81 
 
 
164 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126247  hitchhiker  0.000727987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2387  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.81 
 
 
164 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2375  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.81 
 
 
164 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0991612  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1749  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.2 
 
 
164 aa  214  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.306169  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2270  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.2 
 
 
164 aa  214  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493078  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>