39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0975 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0975  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  751    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727204  normal  0.153799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3129  Fatty acid hydroxylase  58.54 
 
 		 381 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3184  hypothetical protein  63.71 
 
 		 376 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0636163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37130  hypothetical protein  62.94 
 
 		 378 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000362882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2307  hypothetical protein  52.05 
 
 		 371 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3199  putative lipoprotein  53.07 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.160296  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1328  putative lipoprotein  53.35 
 
 		 367 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3072  hypothetical protein  52.47 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2308  putative lipoprotein  53.35 
 
 		 367 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1041  hypothetical protein  53.35 
 
 		 367 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.117784  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1413  hypothetical protein  52.47 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2018  hypothetical protein  52.47 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2669  hypothetical protein  38.07 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110076  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2760  fatty acid hydroxylase  37.21 
 
 		 235 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2854  fatty acid hydroxylase  36.74 
 
 		 235 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286921  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8057  putative membrane protein with short-chain dehydrogenase/reductase  32.69 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3702  fatty acid hydroxylase  32.11 
 
 		 279 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2648  hypothetical protein  35.11 
 
 		 228 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437546  normal  0.57129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2399  fatty acid hydroxylase  34.88 
 
 		 223 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2974  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0787  hypothetical protein  29.05 
 
 		 271 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2889  fatty acid hydroxylase  28.3 
 
 		 272 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00520579  normal  0.0784368 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3325  hypothetical protein  26.89 
 
 		 277 aa  96.3  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.038125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4200  hypothetical protein  32.67 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0571249 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4332  hypothetical protein  31.17 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305332  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3576  hypothetical protein  32.59 
 
 		 178 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.764191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1724  fatty acid hydroxylase-like protein  25.76 
 
 		 209 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0138554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1775  fatty acid hydroxylase-like protein  26.26 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.267446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1478  fatty acid hydroxylase FAH1P  25.76 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1633  fatty acid hydroxylase-like protein  25.25 
 
 		 209 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1670  fatty acid hydroxylase-like protein  24.62 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1701  fatty acid hydroxylase-like protein  25.25 
 
 		 209 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1488  fatty acid hydroxylase FAH1P  24.75 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00473725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1516  fatty acid hydroxylase-like protein  25.25 
 
 		 209 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.567618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3674  fatty acid hydroxylase-like protein  27.67 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.236693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1521  fatty acid hydroxylase  24.62 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5647  fatty acid hydroxylase  26 
 
 		 210 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.220259 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3036  fatty acid hydroxylase  29.94 
 
 		 222 aa  47  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0294  fatty acid hydroxylase  28.75 
 
 		 182 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00278086  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4336  hypothetical protein  33.66 
 
 		 135 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0257983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>