More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0934 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  623  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  77.56 
 
 		 315 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  77.64 
 
 		 313 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  75.96 
 
 		 315 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  75.4 
 
 		 314 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  75.4 
 
 		 314 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  74.36 
 
 		 316 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  75.08 
 
 		 314 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  73.4 
 
 		 316 aa  478  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  74.44 
 
 		 314 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  73.48 
 
 		 314 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  48.55 
 
 		 321 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  46.79 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  46.3 
 
 		 317 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  44.63 
 
 		 306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  47.32 
 
 		 319 aa  232  5e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  45.34 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  41.82 
 
 		 318 aa  221  9e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  42.81 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  43.99 
 
 		 329 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  42.9 
 
 		 317 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  37.26 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  39.87 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  42.04 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  39.49 
 
 		 320 aa  192  8e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  39.17 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  38.26 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  39.46 
 
 		 312 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  38.75 
 
 		 314 aa  162  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  38.98 
 
 		 316 aa  158  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  54.47 
 
 		 132 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  54.47 
 
 		 132 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  53.66 
 
 		 130 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  53.66 
 
 		 132 aa  146  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  52.46 
 
 		 130 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  52.46 
 
 		 130 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  52.46 
 
 		 130 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  52.46 
 
 		 134 aa  139  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  54.1 
 
 		 134 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  51.64 
 
 		 130 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  52.03 
 
 		 129 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  35.26 
 
 		 329 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  35.26 
 
 		 329 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1507  NUDIX hydrolase  32.51 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  51.22 
 
 		 129 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  51.64 
 
 		 129 aa  132  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  52.46 
 
 		 131 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1686  NUDIX hydrolase  30.68 
 
 		 360 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.873349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  55.2 
 
 		 127 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1604  NUDIX hydrolase  30.73 
 
 		 369 aa  126  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  50 
 
 		 131 aa  125  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3395  mutator mutT protein  53.66 
 
 		 131 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  31.8 
 
 		 352 aa  123  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  38.95 
 
 		 198 aa  123  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004482  MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  50.81 
 
 		 132 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  47.58 
 
 		 132 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3747  thiamine monophosphate synthase  41.03 
 
 		 194 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.907624  normal  0.127935 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  45.97 
 
 		 133 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5573  thiamine monophosphate synthase  40.82 
 
 		 194 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  46.77 
 
 		 132 aa  119  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4895  thiamine monophosphate synthase  41.15 
 
 		 194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2246  thiamine monophosphate synthase  39.18 
 
 		 194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  48.76 
 
 		 128 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.72 
 
 		 134 aa  115  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.9 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.9 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.9 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  36.65 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.65 
 
 		 199 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  42.28 
 
 		 126 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  47.37 
 
 		 130 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4453  mutator mutT protein  43.06 
 
 		 144 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0347377  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3677  thiamine monophosphate synthase  38.14 
 
 		 194 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62971  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4514  thiamine monophosphate synthase  38.14 
 
 		 194 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3850  thiamine monophosphate synthase  38.14 
 
 		 194 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.16 
 
 		 132 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.16 
 
 		 129 aa  105  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0104  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.16 
 
 		 132 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000574829  normal  0.261189 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  40.16 
 
 		 129 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  40.16 
 
 		 129 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.37 
 
 		 131 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.37 
 
 		 131 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  40.16 
 
 		 129 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.16 
 
 		 129 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.16 
 
 		 131 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  45.08 
 
 		 386 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.37 
 
 		 129 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.26 
 
 		 131 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.37 
 
 		 131 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.37 
 
 		 131 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.37 
 
 		 129 aa  102  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  45.38 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  45.83 
 
 		 142 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  45 
 
 		 137 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2440  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  37.5 
 
 		 209 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363141  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0878  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  37.5 
 
 		 196 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  45.08 
 
 		 135 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  45.83 
 
 		 137 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0319  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  37.5 
 
 		 209 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  45 
 
 		 135 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>