168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0893 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  100 
 
 		 210 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4700  hypothetical protein  72.33 
 
 		 209 aa  300  8.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00659716  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13000  hypothetical protein  67.79 
 
 		 210 aa  285  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0917  hypothetical protein  73.21 
 
 		 214 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4539  hypothetical protein  73.21 
 
 		 211 aa  271  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4124  hypothetical protein  68.9 
 
 		 211 aa  271  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4414  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  73.21 
 
 		 211 aa  269  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1310  hypothetical protein  73.21 
 
 		 211 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4430  hypothetical protein  69.42 
 
 		 209 aa  267  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104862  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5012  hypothetical protein  60.87 
 
 		 209 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  61.84 
 
 		 209 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  44.61 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1102  hypothetical protein  42.16 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03823  hypothetical protein  44.06 
 
 		 220 aa  148  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1194  hypothetical protein  41.67 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410883  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1407  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  39.35 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  38.61 
 
 		 205 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0310  hypothetical protein  42.79 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.910539  decreased coverage  0.00111956 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  38.61 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1289  hypothetical protein  39.23 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.506664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1093  hypothetical protein  39.23 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.408425 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0278  hypothetical protein  41.5 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.126418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3882  hypothetical protein  38.61 
 
 		 218 aa  137  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  43.35 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  43.35 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0384  putative transmembrane protein  43.48 
 
 		 211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6237  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  41.9 
 
 		 214 aa  134  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0379  hypothetical protein  42.38 
 
 		 214 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2280  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  41.43 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2895  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  41.43 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015798  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2904  alpha/beta fold family hydrolase  41.9 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0409  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  41.43 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal  0.0151787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0279  transmembrane protein  40.19 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0376  putative transmembrane protein  42.31 
 
 		 214 aa  131  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.320901 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2806  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  40.95 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.677247 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2944  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  40.95 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0437  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.71 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0456  hypothetical protein  39.71 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191657  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4922  putative transmembrane protein  40.28 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0177754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0060  hypothetical protein  39.71 
 
 		 214 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0226  hypothetical protein  39.71 
 
 		 214 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1367  hypothetical protein  39.71 
 
 		 214 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3195  hypothetical protein  39.71 
 
 		 214 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0618  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.23 
 
 		 214 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4236  hypothetical protein  40.19 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.258628 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0271  putative transmembrane protein  41.94 
 
 		 219 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  hitchhiker  0.00000187884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0497  hypothetical protein  40.67 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0124611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4219  hypothetical protein  40.19 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.399135 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0266  putative transmembrane protein  41.62 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00224255  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3842  hypothetical protein  55.45 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0196  putative transmembrane protein  41.31 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0379578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0211  hypothetical protein  40.19 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2714  hypothetical protein  37.56 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0977  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.91 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2587  hypothetical protein  37.07 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0226  hypothetical protein  37.32 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0190  hypothetical protein  38.83 
 
 		 215 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479373  normal  0.406587 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0184  putative transmembrane protein  38.83 
 
 		 215 aa  121  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.937664  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0328  hypothetical protein  39.7 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0452  hypothetical protein  34.43 
 
 		 217 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5597  putative alpha/beta superfamily hydrolase  40.2 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0249  putative transmembrane protein  40.95 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00045708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4159  hypothetical protein  35.12 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1671  hydrolase of the alpha/beta superfamily  33.33 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3905  hypothetical protein  55.45 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1964  alpha/beta fold family hydrolase  32.47 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3983  hypothetical protein  55.45 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0331  putative transmembrane protein  40.48 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5218  alpha/beta family hydrolase  37.2 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.58 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1042  hypothetical protein  32.08 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3367  hypothetical protein  35.86 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803242  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1768  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  37.8 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2799  hydrolase  31.78 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285215  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2391  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.86 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0412  hypothetical protein  32.29 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0627  hypothetical protein  31.77 
 
 		 240 aa  96.3  3e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2583  putative hydrolase alpha/beta fold  34.69 
 
 		 219 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141218  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  35.12 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  32.5 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0618  hypothetical protein  35.12 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.376384  normal  0.191604 
 
 
-
 
NC_004310  BR0929  hypothetical protein  34.31 
 
 		 224 aa  92.4  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0923  hypothetical protein  34.31 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  34.95 
 
 		 201 aa  92  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3955  hypothetical protein  38.01 
 
 		 220 aa  91.3  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.341439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1902  putative alpha/beta hydrolase protein  32.41 
 
 		 225 aa  91.3  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2109  putative alpha/beta hydrolase protein  32.41 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  33.17 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  33.82 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  31.8 
 
 		 218 aa  89  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  37.22 
 
 		 223 aa  88.6  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  32.68 
 
 		 218 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  32.2 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  32.68 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  33.5 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  31.71 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  31.71 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2433  hypothetical protein  31.86 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0301699  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1470  hypothetical protein  31.94 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.473504  normal  0.0195157 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2367  hypothetical protein  30.77 
 
 		 217 aa  85.1  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.560308  normal  0.32794 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>