More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0833 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0833  DJ-1 family protein  100 
 
 		 183 aa  364  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4895  DJ-1  70.88 
 
 		 183 aa  246  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1780  DJ-1  49.17 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32791  predicted protein  45.45 
 
 		 191 aa  160  9e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0029  DJ-1  48.89 
 
 		 184 aa  159  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4036  DJ-1 family protein  44.81 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1845  putative protease  46.37 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  40.56 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1009  DJ-1 family protein  43.72 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047613  normal  0.605199 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3081  DJ-1 family protein  42.78 
 
 		 198 aa  144  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.713776  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  45.98 
 
 		 203 aa  144  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  45.98 
 
 		 203 aa  144  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  38.55 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3107  DJ-1 family protein  44.39 
 
 		 196 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3249  DJ-1 family protein  44.39 
 
 		 196 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  38.46 
 
 		 191 aa  141  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 		 388 aa  141  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3069  DJ-1 family protein  44.39 
 
 		 196 aa  141  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2890  DJ-1 family protein  42.25 
 
 		 196 aa  140  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1082  DJ-1 family protein  41.18 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871553 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  37.91 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3185  DJ-1 family protein  41.71 
 
 		 196 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3209  DJ-1 family protein  41.71 
 
 		 196 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000549408 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002695  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazol monophosphate biosynthesis enzyme  41.4 
 
 		 199 aa  138  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00372  hypothetical protein  41.71 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0346  DJ-1 family protein  41.71 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0456  DJ-1 family protein  41.71 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00376  hypothetical protein  41.71 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0460  DJ-1 family protein  41.71 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0508  DJ-1 family protein  41.71 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0496  DJ-1 family protein  41.71 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0640  putative 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  37.85 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00127997  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0891  DJ-1 family protein  42.25 
 
 		 197 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0371  DJ-1 family protein  37.08 
 
 		 181 aa  135  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00995133  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2019  DJ-1 family protein  45.3 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.236764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1034  DJ-1 family protein  41.18 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2034  DJ-1 family protein  41.3 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1208  DJ-1 family protein  45.86 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03289  hypothetical protein  39.78 
 
 		 199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3277  DJ-1 family protein  40.11 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  41.99 
 
 		 182 aa  131  5e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0941  protein ThiJ  40.11 
 
 		 196 aa  130  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.963617  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0623  DJ-1 family protein  40.76 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.226753  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2354  DJ-1 family protein  41.67 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0457203  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0509  DJ-1 family protein  39.89 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2566  DJ-1 family protein  42.94 
 
 		 192 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.290389  normal  0.0127226 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1245  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  39.44 
 
 		 179 aa  124  6e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1215  DJ-1  40 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0634  ThiJ/PfpI family protein  37.91 
 
 		 181 aa  123  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.403728 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1057  DJ-1 family protein  35.52 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0474  DJ-1 family protein  41.71 
 
 		 196 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0472  DJ-1 family protein  41.18 
 
 		 196 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1118  DJ-1 family protein  37.16 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0535  DJ-1 family protein  41.18 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1895  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  38.74 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3290  DJ-1 family protein  41.71 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0493  DJ-1 family protein  41.18 
 
 		 196 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44270  predicted protein  41.71 
 
 		 253 aa  117  7.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563651 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0966  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  38.82 
 
 		 182 aa  117  9e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000883438  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0480  DJ-1 family protein  40.64 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.757447  normal  0.338171 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1633  protein ThiJ  37.36 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0914  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  35.11 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0908  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  35.64 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0978  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  35.11 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0118  DJ-1 family protein  34.97 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0481  DJ-1 family protein  37.7 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.476054  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1238  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazol monophosphate biosynthesis protein-like  42.93 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0083  ThiJ/PfpI domain protein  34.3 
 
 		 195 aa  107  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2774  DJ-1 family protein  40.34 
 
 		 202 aa  107  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_127  DJ-1, 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  34.43 
 
 		 180 aa  107  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  33.33 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0251  DJ-1 family protein  34.43 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4150  ThiJ/PfpI domain protein  35.29 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0065  ThiJ/PfpI domain protein  35.71 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4431  ThiJ/PfpI domain protein  35.29 
 
 		 191 aa  104  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1523  DJ-1 family protein  36.7 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0326  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  37.23 
 
 		 194 aa  102  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000260198  hitchhiker  6.98835e-17 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0832  DJ-1 family protein  33.7 
 
 		 180 aa  101  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0233882 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  33.92 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0894  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate synthesis protein  32.26 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.022908  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0510  DJ-1 family protein  31.49 
 
 		 182 aa  97.8  8e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.000981591  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  31.1 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2085  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1314  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.02067e-17 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2500  DJ-1 family protein  37.85 
 
 		 184 aa  91.3  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0133891  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.59 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3363  ThiJ/PfpI-family thiamine biogenesis protein  29.59 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2146  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.74 
 
 		 185 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.21104e-22 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0928  DJ-1/PfpI family protein  29.59 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1190  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00457983  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl263  putative intracellular protease/amidase  25.97 
 
 		 181 aa  89  3e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.04249e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2477  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.79 
 
 		 185 aa  89  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2091  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 		 180 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.616699  hitchhiker  3.51942e-22 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  31.4 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0843  ThiJ/PfpI domain protein  27.68 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  29.05 
 
 		 366 aa  82  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  33.14 
 
 		 364 aa  80.9  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0802  DJ-1/PfpI family protein  29.02 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1318  peptidase C56, PfpI  33.12 
 
 		 227 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  34.05 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>